More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2249 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
336 aa  680    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  62.69 
 
 
335 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  61.89 
 
 
334 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  60.84 
 
 
344 aa  388  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  59.68 
 
 
340 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  42.77 
 
 
344 aa  239  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  42.47 
 
 
306 aa  235  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  44.91 
 
 
341 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  45.24 
 
 
344 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  41.94 
 
 
352 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0772  histone deacetylase superfamily  41.53 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  42.11 
 
 
345 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  44.41 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0534  histone deacetylase  41.45 
 
 
304 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1974  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 
345 aa  209  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3536  histone deacetylase superfamily  38.54 
 
 
306 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4443  histone deacetylase superfamily protein  40.07 
 
 
306 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  42.21 
 
 
343 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  43 
 
 
378 aa  205  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  38.69 
 
 
312 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  38.69 
 
 
312 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  39.74 
 
 
316 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  41.55 
 
 
331 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  39.5 
 
 
337 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4185  histone deacetylase superfamily protein  39.1 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  39.5 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2616  histone deacetylase superfamily protein  41.84 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  39.8 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  44.41 
 
 
345 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  41.04 
 
 
328 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  42.27 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  36.69 
 
 
370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  39.18 
 
 
316 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  41.67 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.58 
 
 
346 aa  196  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  40.66 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  42.9 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  37.58 
 
 
309 aa  195  7e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  40.46 
 
 
309 aa  196  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  41.33 
 
 
311 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.46 
 
 
380 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  40.89 
 
 
307 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  38.46 
 
 
380 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  38.18 
 
 
309 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  45.52 
 
 
330 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  39.59 
 
 
309 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  43.28 
 
 
365 aa  192  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  34.08 
 
 
322 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  42.07 
 
 
372 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  39.47 
 
 
309 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4049  Histone deacetylase  41.64 
 
 
359 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248474  normal  0.645592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  45.61 
 
 
342 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  40 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34647  predicted protein  39.04 
 
 
399 aa  189  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36543  predicted protein  39.04 
 
 
399 aa  189  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  40.13 
 
 
309 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  39.14 
 
 
309 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  38.51 
 
 
309 aa  189  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  35.38 
 
 
379 aa  189  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  38.35 
 
 
369 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  35.47 
 
 
341 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  37.41 
 
 
309 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1200  histone deacetylase superfamily protein  41.55 
 
 
309 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  37.41 
 
 
309 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  38.36 
 
 
348 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  36.31 
 
 
373 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  36.42 
 
 
341 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4605  histone deacetylase superfamily protein  38.7 
 
 
314 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0999  deacetylase  38.64 
 
 
311 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2921  histone deacetylase superfamily  44.41 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  37.07 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  38.1 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  36.68 
 
 
364 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  37.18 
 
 
336 aa  182  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  39.36 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  36.96 
 
 
328 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 
307 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  38.31 
 
 
313 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  35.64 
 
 
341 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  37.29 
 
 
309 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2124  acetylpolyamine aminohydolase  39.68 
 
 
323 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607097  normal  0.684663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  36.86 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 
307 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.29 
 
 
308 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  40.88 
 
 
366 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  39.66 
 
 
309 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  42.8 
 
 
370 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  38.1 
 
 
369 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  36.27 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  35 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0510  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  39.19 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  38.6 
 
 
373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  37.73 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0381  histone deacetylase superfamily protein  36.74 
 
 
336 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0601969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  40.27 
 
 
310 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  35.78 
 
 
317 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  34.92 
 
 
321 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  35.45 
 
 
340 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  36.63 
 
 
369 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>