270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2123 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
395 aa  751    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
390 aa  250  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0861  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
387 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.605059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 
385 aa  239  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 
417 aa  236  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  26.88 
 
 
395 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.17 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.6 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  24.19 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  26.02 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  29.37 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  24.85 
 
 
397 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.6 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.28 
 
 
448 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
409 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 
394 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.06 
 
 
436 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
413 aa  59.7  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
388 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.6 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  28.74 
 
 
512 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.34 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.79 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.122733  normal  0.430828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
395 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.59 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  22.97 
 
 
418 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  24.12 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  24.48 
 
 
415 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  21.07 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.58 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  21.58 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1899  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  23.46 
 
 
406 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.88 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  23.58 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.34 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  26.29 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  23.91 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
515 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  26.29 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  26.29 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  24.12 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  24.12 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  31.25 
 
 
439 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  33.14 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  25.15 
 
 
488 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.43 
 
 
412 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  31.25 
 
 
439 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.64 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
400 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.99 
 
 
543 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  26.8 
 
 
423 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0839112  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  24.57 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  29.19 
 
 
512 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  29.19 
 
 
512 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.99 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  29.19 
 
 
512 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  29.19 
 
 
512 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  29.19 
 
 
512 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  29.19 
 
 
512 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  26.03 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  24.75 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  23.33 
 
 
449 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 
489 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  23.9 
 
 
463 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
409 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  23.9 
 
 
463 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  23.9 
 
 
463 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
219 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 
443 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
504 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  23.53 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.21 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  23.33 
 
 
449 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.95 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  23.33 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  23.53 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  21.86 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.86 
 
 
455 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3902  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.088151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  23.33 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  20.14 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  23.33 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  22.96 
 
 
449 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.56 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  21.66 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>