More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2077 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2077  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 572 aa  1122    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.35562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  39.26 
 
 		 606 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  45.78 
 
 		 583 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  42.78 
 
 		 545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  42.51 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  42.09 
 
 		 659 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  42.09 
 
 		 659 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  41.14 
 
 		 667 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  39.18 
 
 		 529 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  41.15 
 
 		 657 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  39.09 
 
 		 637 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  41.65 
 
 		 676 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  39.36 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  41.06 
 
 		 685 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  42.83 
 
 		 673 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  42.83 
 
 		 691 aa  365  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  41.86 
 
 		 682 aa  365  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  42.46 
 
 		 661 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1055  choline/carnitine/betaine transporter  44.31 
 
 		 520 aa  363  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.144567  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  38.64 
 
 		 535 aa  363  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  42.69 
 
 		 660 aa  362  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0980  choline/carnitine/betaine transport  41.61 
 
 		 548 aa  362  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  42.21 
 
 		 676 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  42.11 
 
 		 676 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  40.7 
 
 		 574 aa  360  4e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  41.7 
 
 		 698 aa  359  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  39.57 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  40.46 
 
 		 534 aa  359  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  40.08 
 
 		 682 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  41.35 
 
 		 661 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  39.77 
 
 		 656 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  44.26 
 
 		 546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  42.41 
 
 		 676 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  42.41 
 
 		 676 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  41.79 
 
 		 526 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4934  choline/carnitine/betaine transporter  38.27 
 
 		 667 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  43.35 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  38.59 
 
 		 584 aa  355  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5061  choline/carnitine/betaine transporter  38.27 
 
 		 667 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  40.54 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  41.65 
 
 		 567 aa  355  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  40.59 
 
 		 716 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  40.59 
 
 		 716 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5112  choline/carnitine/betaine transporter  38.09 
 
 		 667 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  43.14 
 
 		 661 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  40.51 
 
 		 551 aa  352  8e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0404  choline/carnitine/betaine transporter  37.9 
 
 		 667 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.766464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  39.06 
 
 		 553 aa  352  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  42.35 
 
 		 664 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  41.95 
 
 		 668 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  39.26 
 
 		 684 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  37.19 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  42.04 
 
 		 676 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  42.04 
 
 		 676 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  42.04 
 
 		 676 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  42.04 
 
 		 676 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  42.04 
 
 		 676 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6160  choline transporter BetT  38.76 
 
 		 534 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  41.95 
 
 		 660 aa  349  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  41.36 
 
 		 523 aa  349  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  40.59 
 
 		 503 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  43.02 
 
 		 531 aa  346  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  39.42 
 
 		 550 aa  346  8e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  38.68 
 
 		 526 aa  346  8.999999999999999e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  40 
 
 		 676 aa  345  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  36.54 
 
 		 514 aa  345  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  38.28 
 
 		 653 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  43.06 
 
 		 524 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  37.94 
 
 		 671 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  41.3 
 
 		 667 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  37.94 
 
 		 540 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  39.73 
 
 		 530 aa  343  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  41.67 
 
 		 662 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  41.11 
 
 		 667 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  41.11 
 
 		 667 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0345  choline transport protein BetT  37.17 
 
 		 677 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  41.11 
 
 		 667 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  38.48 
 
 		 665 aa  343  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01883  choline/carnitine/betaine transporter  42.74 
 
 		 529 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00270  choline transporter of high affinity  37.17 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3292  choline/carnitine/betaine transporter  37.17 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0331  choline transport protein BetT  37.17 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00273  hypothetical protein  37.17 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0376  choline transport protein BetT  37.17 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3309  choline transport protein BetT  37.17 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0373  choline transport protein BetT  37.17 
 
 		 677 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  39.49 
 
 		 573 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  39.96 
 
 		 526 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 		 531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  39.46 
 
 		 573 aa  341  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  40.16 
 
 		 687 aa  340  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  38.77 
 
 		 539 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2323  glycine betaine transporter  41.77 
 
 		 525 aa  340  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100678  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  38.95 
 
 		 558 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  40.4 
 
 		 673 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  36.88 
 
 		 681 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0247  BCCT transporter  37.65 
 
 		 666 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  0.516419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  36.75 
 
 		 582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  40.51 
 
 		 658 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  41.08 
 
 		 543 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>