28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1980 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  655    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  57.36 
 
 
342 aa  339  5e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  41.37 
 
 
339 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  43.66 
 
 
337 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  29.89 
 
 
347 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  29.91 
 
 
341 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  29.77 
 
 
344 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  22.84 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  38.95 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  20.99 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  27.45 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  20.99 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  20.99 
 
 
340 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  31.08 
 
 
854 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1659  hypothetical protein  40.78 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  27.24 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  21.07 
 
 
333 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.28 
 
 
347 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  46 
 
 
872 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  39.62 
 
 
862 aa  46.2  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  39.47 
 
 
792 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  31.72 
 
 
773 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  26.89 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  39.6 
 
 
896 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  24.58 
 
 
330 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  34.67 
 
 
859 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  31.65 
 
 
795 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>