192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1836 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 
170 aa  337  5.9999999999999996e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  51.53 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.96 
 
 
172 aa  134  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.42 
 
 
175 aa  134  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  43.27 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  39.13 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  34.12 
 
 
186 aa  84.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  35.4 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  35.48 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  31.82 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  34.4 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  30.06 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.66 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  28.57 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  27.61 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.36 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.13 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  36.13 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.15 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.61 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.94 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  28.21 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  34.04 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  34.38 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.89 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  35.48 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  28.21 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  32.85 
 
 
151 aa  62  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  29.56 
 
 
155 aa  62  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  33.8 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  26.59 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  28.21 
 
 
171 aa  61.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.64 
 
 
150 aa  61.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.78 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.13 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.14 
 
 
171 aa  60.8  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  31.86 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.01 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  32.03 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.64 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  33.12 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.21 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  31.21 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  35.14 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  35.09 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  35.09 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  35.09 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  35.09 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.61 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.37 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  33.61 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  33.61 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  28.87 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  33.61 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  33.61 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  33.61 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  32.03 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  29.53 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  32.7 
 
 
188 aa  58.2  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  29.68 
 
 
152 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  29.19 
 
 
161 aa  57.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  29.38 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  31.97 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.97 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  31.97 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  31.97 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.62 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  32.5 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  27.57 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  31.97 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  31.97 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  28.57 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  31.97 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  31.97 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  31.97 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.37 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  28.81 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  34.15 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  32.79 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  29.61 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  33.09 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  31.69 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  37 
 
 
183 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  32.12 
 
 
182 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.58 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  33.33 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  35.19 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
164 aa  54.3  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  26.51 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  31.88 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  29.33 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.22 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.86 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  31.76 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.33 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.59 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.33 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>