41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1760 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1031    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  53.07 
 
 
299 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  52.94 
 
 
301 aa  279  7e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  51.66 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  51.66 
 
 
289 aa  263  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  35.66 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  39.3 
 
 
253 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3213  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.976999  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0261  hypothetical protein  31.9 
 
 
401 aa  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1054  hypothetical protein  33.01 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2178  hypothetical protein  29.24 
 
 
359 aa  89.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1132  hypothetical protein  31.22 
 
 
268 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.18 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162981 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3458  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.38 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 
233 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.58 
 
 
135 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.84 
 
 
121 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.56 
 
 
135 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.78 
 
 
133 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.69 
 
 
122 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.32 
 
 
233 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0081  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.08 
 
 
250 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.53662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1835  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.89 
 
 
244 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171582  normal  0.548174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.68 
 
 
133 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.91 
 
 
143 aa  50.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0675  hypothetical protein  27.33 
 
 
239 aa  50.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.23 
 
 
131 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.76 
 
 
143 aa  47.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  27.69 
 
 
259 aa  47.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.72 
 
 
133 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  27.34 
 
 
130 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.6 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1566  hypothetical protein  24.49 
 
 
229 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31 
 
 
330 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.32 
 
 
229 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.47 
 
 
130 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.922542 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1387  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.65 
 
 
128 aa  44.3  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  37.21 
 
 
150 aa  44.3  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.9 
 
 
146 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  30.88 
 
 
129 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  35.29 
 
 
146 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>