More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1654 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1654  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  37.38 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  33.05 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.06 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  33.62 
 
 		 267 aa  114  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  34.05 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  33.05 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2743  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  32.78 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1292  ABC transporter related  33.95 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325638  normal  0.33729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  33.49 
 
 		 301 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  34.78 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1396  ABC transporter related  34.44 
 
 		 293 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.299838  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  32.06 
 
 		 457 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  33.18 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3320  ABC transporter related  35.37 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  34.45 
 
 		 301 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  32.49 
 
 		 359 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  32.84 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  31.97 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  34.1 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  32.61 
 
 		 320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.06 
 
 		 368 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  30.47 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.7 
 
 		 316 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1424  ABC transporter-related protein  33.74 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1000  ABC transporter related  34.02 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  36.49 
 
 		 741 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  35.75 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0751  ABC transporter related  34.25 
 
 		 365 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0700  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.38 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  34.36 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4009  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  34.02 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  34.29 
 
 		 316 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  32.55 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  29.33 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  32.44 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3934  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  32.64 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3378  ABC transporter related  33.89 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  34.16 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.11 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  27.07 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3812  putative bacteriocin ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  31.36 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1723  ABC transporter related  35.68 
 
 		 324 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0159508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1754  ABC transporter related  29.06 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  31.02 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  28.03 
 
 		 295 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0023  ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  33.8 
 
 		 304 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1233  ABC transporter related  33.8 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.954644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  34.25 
 
 		 308 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  30.38 
 
 		 353 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  31.17 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  32.27 
 
 		 333 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  31.8 
 
 		 316 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3616  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  31.91 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3378  ABC transporter related protein  32.57 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3903  bacteriocin ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  30.09 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1087  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  32.08 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  32.58 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.22 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  33.48 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3208  ABC transporter related  33.47 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4429  ABC transporter  32.78 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1100  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  30.83 
 
 		 276 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.873778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  30.88 
 
 		 337 aa  104  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  33.8 
 
 		 304 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  33.8 
 
 		 304 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  31.46 
 
 		 368 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  31.44 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  30.14 
 
 		 353 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  32.03 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3748  ABC transporter related  33.33 
 
 		 322 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  31.74 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  33.33 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  31.43 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  33.93 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4888  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  35.16 
 
 		 325 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  31.02 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2870  ABC alpha-glucoside transporter, ATPase subunit AglK  34.09 
 
 		 369 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0548699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  31.28 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3635  ABC transporter related  33.33 
 
 		 322 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  0.045877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  31.37 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.75 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1516  ABC transporter related  34.09 
 
 		 369 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00369229  normal  0.0599486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  31.91 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  31.47 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  32.35 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4364  ABC transporter-like  31.4 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.644241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  31.25 
 
 		 247 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3439  ABC transporter related  32.84 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.145905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>