234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1558 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
203 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  83.59 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  71.21 
 
 
203 aa  284  7e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  67.34 
 
 
204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  63.21 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  56.52 
 
 
210 aa  232  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  38.07 
 
 
207 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  41.12 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  42.41 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  39.18 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  34.54 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  34.33 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  40.5 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  35.47 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  38.14 
 
 
198 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  34.2 
 
 
221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  36.5 
 
 
211 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  34.69 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  37.88 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  41.51 
 
 
197 aa  125  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  34.17 
 
 
205 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  33.16 
 
 
212 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  34.69 
 
 
211 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  122  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  48.84 
 
 
200 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  39.47 
 
 
204 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  34.36 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  34.36 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  37.22 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  35.11 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  38.89 
 
 
216 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  42.07 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  34.15 
 
 
208 aa  118  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.33 
 
 
211 aa  117  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  117  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  38 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  33.85 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  37.37 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  32.82 
 
 
211 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.13 
 
 
208 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.33 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  36.6 
 
 
213 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  32.99 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34.31 
 
 
207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  36.02 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  35.32 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  38.58 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  37.88 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  39.39 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  32.82 
 
 
211 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  38.89 
 
 
209 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.37 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  38.41 
 
 
172 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  34.39 
 
 
200 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  40 
 
 
303 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  34.31 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  37.95 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  35.26 
 
 
195 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  29.08 
 
 
192 aa  108  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  34.74 
 
 
218 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  35.47 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  34.74 
 
 
194 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  35.42 
 
 
194 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  34.74 
 
 
239 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  35.16 
 
 
195 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  34.9 
 
 
197 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  37.43 
 
 
212 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  36.08 
 
 
213 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  33.16 
 
 
198 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  31.84 
 
 
205 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  35.86 
 
 
212 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  36.26 
 
 
195 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  34.9 
 
 
195 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  36.26 
 
 
195 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  36.26 
 
 
195 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  36.76 
 
 
290 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  34.62 
 
 
195 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  34.74 
 
 
201 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  34.62 
 
 
195 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  34.38 
 
 
222 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  35.38 
 
 
218 aa  104  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.71 
 
 
205 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  39.74 
 
 
202 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  34.9 
 
 
194 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0251  hypothetical protein  32.04 
 
 
193 aa  103  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  32.49 
 
 
214 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  39.27 
 
 
206 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  30.81 
 
 
211 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  40.82 
 
 
205 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  36.27 
 
 
206 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  40.85 
 
 
210 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  34.21 
 
 
204 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  33.7 
 
 
203 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  35.83 
 
 
213 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>