More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1541 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  72.92 
 
 
498 aa  649    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  100 
 
 
486 aa  917    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  35.91 
 
 
504 aa  243  7e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  36.5 
 
 
498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  34.66 
 
 
500 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  33.81 
 
 
481 aa  231  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  36.52 
 
 
502 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  34.11 
 
 
481 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  36.02 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  35.23 
 
 
478 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  31.47 
 
 
475 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  28.94 
 
 
469 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
438 aa  147  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  29.44 
 
 
461 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.82 
 
 
467 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.5 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  31.31 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.81 
 
 
464 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.29 
 
 
458 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
475 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
459 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.51 
 
 
453 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
500 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  30.95 
 
 
473 aa  134  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
461 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.36 
 
 
500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
468 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
485 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27 
 
 
518 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
464 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
464 aa  126  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
461 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
525 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  31.12 
 
 
470 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.91 
 
 
467 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.63 
 
 
500 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.4 
 
 
498 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.79 
 
 
490 aa  123  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
499 aa  123  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.99 
 
 
469 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.94 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  23.3 
 
 
462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
468 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  28.29 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  30.79 
 
 
469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.3 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  24.45 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.64 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  24.24 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.03 
 
 
496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  31.79 
 
 
483 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
448 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.37 
 
 
450 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
485 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
554 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  31.82 
 
 
483 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
477 aa  106  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  27.36 
 
 
463 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
455 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28350  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  29.18 
 
 
428 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00440405  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  29.8 
 
 
452 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  27.36 
 
 
463 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26 
 
 
538 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
445 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.57 
 
 
454 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  29.18 
 
 
455 aa  103  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.93 
 
 
472 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.34 
 
 
467 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30 
 
 
459 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
470 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
452 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6399  MATE efflux family protein  29.53 
 
 
425 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.88 
 
 
468 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  25.97 
 
 
408 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  30.26 
 
 
452 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.95 
 
 
495 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
454 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.51 
 
 
454 aa  97.4  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
453 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.57 
 
 
448 aa  97.1  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
447 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  24.83 
 
 
429 aa  95.5  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.66 
 
 
446 aa  95.1  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.69 
 
 
453 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  29.07 
 
 
455 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.67 
 
 
546 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.28 
 
 
484 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
455 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
447 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
455 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.67 
 
 
495 aa  94  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.34 
 
 
484 aa  94  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.73 
 
 
546 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
456 aa  93.6  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>