171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1449 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
330 aa  682    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  72.42 
 
 
330 aa  528  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  53.82 
 
 
331 aa  394  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.95 
 
 
321 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.17 
 
 
338 aa  278  8e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  39.58 
 
 
330 aa  278  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  37.27 
 
 
330 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  37.88 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.51 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  39.27 
 
 
330 aa  268  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  41.57 
 
 
331 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  37.46 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  39.27 
 
 
331 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.32 
 
 
333 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.76 
 
 
331 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  36.97 
 
 
326 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  37.5 
 
 
360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.16 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  36.25 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.35 
 
 
330 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  39.1 
 
 
333 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.56 
 
 
330 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.25 
 
 
330 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  36.72 
 
 
333 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  37.35 
 
 
331 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.07 
 
 
330 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  39.37 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  38.37 
 
 
330 aa  238  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.53 
 
 
331 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.73 
 
 
319 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.26 
 
 
333 aa  226  6e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  32.62 
 
 
333 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  35.76 
 
 
335 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  40.08 
 
 
259 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  35.67 
 
 
321 aa  209  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  35.06 
 
 
334 aa  206  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  33.86 
 
 
322 aa  202  9e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.28 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.05 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.62 
 
 
326 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  33.54 
 
 
326 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  31.09 
 
 
332 aa  166  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 
332 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  31.15 
 
 
545 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  28.48 
 
 
325 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  28.48 
 
 
325 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  27.64 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  27.1 
 
 
325 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.67 
 
 
544 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  29.09 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  29.81 
 
 
553 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.34 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.55 
 
 
339 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.14 
 
 
330 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  32.3 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.14 
 
 
343 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 
331 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  26.4 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  26.75 
 
 
343 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  27.67 
 
 
598 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.58 
 
 
341 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.38 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  29.57 
 
 
346 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  25.62 
 
 
343 aa  126  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  27.83 
 
 
343 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  28.23 
 
 
346 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  29.35 
 
 
594 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  28.18 
 
 
344 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.74 
 
 
343 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  27.92 
 
 
339 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  27.6 
 
 
339 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.16 
 
 
350 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.03 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  28.62 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.71 
 
 
558 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.61 
 
 
570 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.61 
 
 
343 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.09 
 
 
343 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.19 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  26.81 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  29.53 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.67 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.66 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  29.84 
 
 
525 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.5 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  27.52 
 
 
326 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.27 
 
 
559 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.76 
 
 
344 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.76 
 
 
580 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.25 
 
 
342 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.83 
 
 
347 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.14 
 
 
343 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  25.55 
 
 
338 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  26.27 
 
 
323 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  27.51 
 
 
344 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  25.84 
 
 
342 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  24.01 
 
 
343 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.33 
 
 
550 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  25.8 
 
 
334 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.15 
 
 
333 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>