76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1344 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  100 
 
 
873 aa  1740    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  32.3 
 
 
1086 aa  220  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  30.86 
 
 
1276 aa  180  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  31.17 
 
 
891 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  27.36 
 
 
554 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.72 
 
 
602 aa  99  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  29.41 
 
 
604 aa  94.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  29.88 
 
 
803 aa  94.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  30.7 
 
 
801 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  26.67 
 
 
564 aa  92.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  26.58 
 
 
562 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  25.55 
 
 
448 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  28.73 
 
 
436 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  28.71 
 
 
605 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  24.35 
 
 
1141 aa  90.1  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  30.34 
 
 
425 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  27.01 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  26.88 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.9 
 
 
596 aa  79  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.17 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  29.32 
 
 
534 aa  75.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  27.02 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25.2 
 
 
662 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.42 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.42 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.42 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  28.93 
 
 
500 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  24.47 
 
 
450 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  24.52 
 
 
442 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  24.71 
 
 
461 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.61 
 
 
584 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  27.36 
 
 
508 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  24.76 
 
 
442 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  24.66 
 
 
392 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.71 
 
 
444 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  27.84 
 
 
453 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  30.53 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  30.53 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  30.53 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  30.53 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  26.74 
 
 
489 aa  59.7  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  30.53 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  26.57 
 
 
447 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  30.53 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  30.53 
 
 
442 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  24.33 
 
 
446 aa  58.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.88 
 
 
437 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  29.82 
 
 
340 aa  56.6  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  22.64 
 
 
444 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  26.98 
 
 
408 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  22.65 
 
 
437 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  23.37 
 
 
326 aa  54.3  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  29.46 
 
 
369 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  30.06 
 
 
1025 aa  51.2  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  25.4 
 
 
501 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  27.04 
 
 
457 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  23.08 
 
 
415 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  25.82 
 
 
654 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  25.44 
 
 
760 aa  49.7  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  29.88 
 
 
372 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  25.25 
 
 
380 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  27.83 
 
 
468 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  20.67 
 
 
586 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  24.93 
 
 
743 aa  47  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  25.51 
 
 
596 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1426  hypothetical protein  24.68 
 
 
431 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0176369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  26.55 
 
 
482 aa  45.8  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  26.67 
 
 
510 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  26.67 
 
 
510 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  26.67 
 
 
510 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  34.21 
 
 
510 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  34.21 
 
 
452 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  34.21 
 
 
510 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  27.89 
 
 
864 aa  44.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  36 
 
 
558 aa  44.3  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.67 
 
 
501 aa  44.3  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>