More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1318 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  100 
 
 
628 aa  1216    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  61.92 
 
 
626 aa  687    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  67.09 
 
 
630 aa  769    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  51.94 
 
 
617 aa  596  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  52.67 
 
 
617 aa  553  1e-156  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  37.87 
 
 
610 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  32.08 
 
 
612 aa  349  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 
620 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  34.42 
 
 
641 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  33.2 
 
 
652 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  33.2 
 
 
652 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  30.56 
 
 
640 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 
628 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  33.13 
 
 
629 aa  207  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 
601 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  29.64 
 
 
597 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 
651 aa  200  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 
601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 
601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  33.91 
 
 
611 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  33.91 
 
 
611 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  31.98 
 
 
637 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  33.48 
 
 
608 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.02 
 
 
599 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.02 
 
 
596 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  32.39 
 
 
607 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  29.62 
 
 
596 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.62 
 
 
596 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.62 
 
 
596 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.82 
 
 
596 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 
599 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.62 
 
 
596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  33.92 
 
 
625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 
596 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  31.46 
 
 
637 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 
639 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  33.48 
 
 
602 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.99 
 
 
666 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 
616 aa  187  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  31.35 
 
 
760 aa  187  6e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  30.41 
 
 
598 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 
569 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  32.22 
 
 
741 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 
619 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 
852 aa  180  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 
764 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  37.89 
 
 
593 aa  179  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  29.07 
 
 
625 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  28.86 
 
 
606 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 
611 aa  177  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 
602 aa  177  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
617 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.06 
 
 
669 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.68 
 
 
763 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 
670 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 
670 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 
673 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 
616 aa  174  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 
719 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  29.09 
 
 
604 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  32.31 
 
 
660 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  32.31 
 
 
660 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  32.53 
 
 
660 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  32.31 
 
 
660 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  31.05 
 
 
643 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  30.04 
 
 
622 aa  167  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  30.04 
 
 
623 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 
660 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 
702 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 
607 aa  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.03 
 
 
595 aa  150  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 
609 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  27.46 
 
 
640 aa  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.38 
 
 
399 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.5 
 
 
399 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 
584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.27 
 
 
401 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  28.78 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  34.84 
 
 
218 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 
221 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  31.78 
 
 
221 aa  109  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  32.67 
 
 
221 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  34 
 
 
222 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  29.5 
 
 
498 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.99 
 
 
402 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  28.69 
 
 
414 aa  100  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  32.59 
 
 
226 aa  97.1  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  33.98 
 
 
214 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  32 
 
 
218 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 
491 aa  96.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  34.7 
 
 
220 aa  94  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  31.05 
 
 
221 aa  94  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  35.35 
 
 
220 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  28.48 
 
 
572 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.43 
 
 
498 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  28.99 
 
 
498 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 
223 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
222 aa  92  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>