49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1120 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
478 aa  941    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
475 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
504 aa  99.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.66 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 
490 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 
479 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
485 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 
476 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 
480 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.95 
 
 
464 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
427 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
583 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  31.41 
 
 
433 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  29.08 
 
 
483 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
494 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
471 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  19.45 
 
 
484 aa  53.5  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  26.3 
 
 
489 aa  53.9  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 
446 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.65 
 
 
488 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 
515 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 
505 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
500 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 
477 aa  50.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
463 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 
477 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  24.89 
 
 
492 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  27.4 
 
 
506 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 
476 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 
476 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.89 
 
 
517 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
500 aa  47  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 
504 aa  47  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.22 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  23.17 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1162  polysaccharide biosynthesis protein CpsL  23.5 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.333664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1240  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  23.51 
 
 
475 aa  43.5  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>