27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1064 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  100 
 
 
353 aa  726    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  27.75 
 
 
349 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  27.2 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  28.61 
 
 
860 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  28.66 
 
 
377 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  25.95 
 
 
337 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  25.63 
 
 
337 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  25.63 
 
 
337 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  29.93 
 
 
341 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  25.9 
 
 
340 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  25.08 
 
 
337 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  31.44 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  24.37 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  28.77 
 
 
329 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  27.54 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  30.22 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  29.91 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  21.36 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  22.65 
 
 
354 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  23.91 
 
 
350 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  24.17 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  27.61 
 
 
353 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  23.03 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  23.55 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  24.44 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  22.84 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  21.88 
 
 
374 aa  43.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>