112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0934 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 
348 aa  705    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  65.32 
 
 
355 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  56.73 
 
 
348 aa  384  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  55.03 
 
 
350 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  45.91 
 
 
351 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  28.45 
 
 
360 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  32.15 
 
 
359 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  29.39 
 
 
366 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  25.16 
 
 
321 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  30.52 
 
 
330 aa  98.6  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  28.49 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  27.3 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  28.49 
 
 
401 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  30.25 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  25.42 
 
 
456 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  31.28 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  28.07 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  25.99 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  30.84 
 
 
564 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.38 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  24.92 
 
 
542 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 
513 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 
516 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 
349 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  28.48 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.42 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.53 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  27.52 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  28.53 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  28.53 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  21.84 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  26.67 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  28.3 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  26.42 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  29.36 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.08 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.04 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  26.9 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  26.92 
 
 
273 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  22.46 
 
 
470 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  19.31 
 
 
340 aa  63.5  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  26.98 
 
 
505 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2705  squalene/phytoene synthase  25.7 
 
 
269 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000135521  hitchhiker  0.00000104011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  33.61 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  26.04 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  26.04 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.53 
 
 
274 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.71 
 
 
276 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3153  squalene synthase HpnC  25.23 
 
 
298 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  25.95 
 
 
270 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  29.37 
 
 
310 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  25.65 
 
 
296 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  26.24 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1696  putative phytoene synthase-like protein  25.68 
 
 
281 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635329  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  31.93 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  22.31 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1510  squalene synthase HpnC  31.67 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.012089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  30.63 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  31.73 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  21.4 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  28.25 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  27.41 
 
 
280 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1828  squalene synthase HpnC  28.95 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  21.15 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  24.25 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  31.43 
 
 
277 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2961  squalene/phytoene synthase  26.47 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277039  hitchhiker  0.00507473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  27.4 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  23.39 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.53 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1941  squalene synthase HpnC  27.19 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.692084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3240  squalene synthase HpnC  29.91 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7143  squalene synthase HpnC  27.59 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  27.97 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  20.62 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  25.55 
 
 
292 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4264  squalene synthase HpnC  26.72 
 
 
292 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  23.51 
 
 
349 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  30.58 
 
 
279 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  23.51 
 
 
349 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.33 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.41 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0119  squalene/phytoene synthase  24.77 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2217  squalene synthase HpnC  26.55 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  25.86 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  27.64 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  28.1 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  23.53 
 
 
575 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0064  phytoene/squalene synthetase  22.52 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0305  squalene/phytoene synthase  23.33 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  29.37 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  23.99 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  25 
 
 
278 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  26.49 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  32.28 
 
 
283 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>