More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0788 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  100 
 
 
367 aa  729    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  60.54 
 
 
374 aa  433  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  52.89 
 
 
372 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  54.27 
 
 
379 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  32.04 
 
 
404 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  29.17 
 
 
395 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  28.91 
 
 
395 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  32.05 
 
 
394 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  31.47 
 
 
394 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.58 
 
 
421 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.78 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  32.21 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  32.4 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.83 
 
 
414 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.18 
 
 
412 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32 
 
 
417 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  29.51 
 
 
368 aa  170  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  30.85 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.08 
 
 
644 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.16 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  33.08 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.67 
 
 
414 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  32 
 
 
412 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  31.63 
 
 
880 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.38 
 
 
418 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.5 
 
 
414 aa  159  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.55 
 
 
425 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.08 
 
 
406 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  30 
 
 
379 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  28.86 
 
 
412 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.98 
 
 
435 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  32.37 
 
 
424 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  31.3 
 
 
885 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.57 
 
 
415 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  31.4 
 
 
429 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  29.69 
 
 
401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.07 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.57 
 
 
444 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.01 
 
 
426 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  32.31 
 
 
393 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.55 
 
 
451 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.73 
 
 
406 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.41 
 
 
605 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.27 
 
 
419 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  30.13 
 
 
661 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  32.92 
 
 
417 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.83 
 
 
673 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  29.67 
 
 
392 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  31.41 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.9 
 
 
650 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.57 
 
 
404 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.5 
 
 
414 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.76 
 
 
421 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  27.32 
 
 
425 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.31 
 
 
443 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.66 
 
 
407 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1322  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.3 
 
 
439 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.68 
 
 
414 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.08 
 
 
672 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.4 
 
 
406 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  26.29 
 
 
376 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.22 
 
 
413 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.4 
 
 
666 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.08 
 
 
674 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  29.97 
 
 
394 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  31.99 
 
 
441 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.57 
 
 
408 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.5 
 
 
414 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  29.22 
 
 
666 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.08 
 
 
406 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.58 
 
 
418 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  28.01 
 
 
419 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  28 
 
 
413 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  28 
 
 
413 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.75 
 
 
406 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  29.15 
 
 
682 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.8 
 
 
641 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.33 
 
 
429 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  31.44 
 
 
422 aa  149  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.56 
 
 
604 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.1 
 
 
410 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.56 
 
 
604 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.59 
 
 
415 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.83 
 
 
664 aa  149  8e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.08 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  31.52 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.68 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.07 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  28.38 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  28.07 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  31.07 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  28.07 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  32.26 
 
 
379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.75 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  31.88 
 
 
896 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.5 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  28.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.32 
 
 
420 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  28.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.29 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>