More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0747 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  100 
 
 		 490 aa  946    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  62.07 
 
 		 485 aa  565  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  59.28 
 
 		 518 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  63.93 
 
 		 486 aa  542  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  58.68 
 
 		 499 aa  538  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  54.34 
 
 		 498 aa  487  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  52.5 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  49.49 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  39.96 
 
 		 554 aa  322  7e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  41.21 
 
 		 538 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  37.7 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  40.87 
 
 		 525 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  41.63 
 
 		 481 aa  292  8e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  34.79 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 468 aa  256  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  33.73 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  33.2 
 
 		 500 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  34.66 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  31.62 
 
 		 462 aa  229  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 455 aa  209  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 460 aa  203  7e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.39 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 477 aa  186  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.72 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 467 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.79 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  30.19 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 480 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.05 
 
 		 496 aa  156  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  28.92 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  28.7 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  28.54 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  26.7 
 
 		 469 aa  153  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  27.33 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.48 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 463 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.18 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.29 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  31.45 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  30.94 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 461 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.35 
 
 		 482 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  27.5 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  27.55 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 503 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 454 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 460 aa  130  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 464 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.99 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  26.42 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>