More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0636 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  100 
 
 
616 aa  1190    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  45.27 
 
 
622 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  46.12 
 
 
623 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  45.51 
 
 
627 aa  462  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  46.81 
 
 
618 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  40.54 
 
 
597 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  38.75 
 
 
596 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  38.59 
 
 
602 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  38.39 
 
 
596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  38.65 
 
 
596 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  37.05 
 
 
588 aa  336  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.9 
 
 
588 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  35.51 
 
 
596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  32.96 
 
 
612 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.9 
 
 
589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  36.27 
 
 
588 aa  304  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 
598 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.58 
 
 
609 aa  296  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  32.08 
 
 
589 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  32.43 
 
 
624 aa  286  5.999999999999999e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.3 
 
 
588 aa  286  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  32.85 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.41 
 
 
605 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.46 
 
 
605 aa  277  5e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.89 
 
 
601 aa  276  7e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.84 
 
 
609 aa  276  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.46 
 
 
605 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.5 
 
 
592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.48 
 
 
613 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  32.64 
 
 
613 aa  274  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  30.88 
 
 
602 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  30.88 
 
 
602 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
592 aa  273  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 
607 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 
592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  30.62 
 
 
602 aa  271  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  33.87 
 
 
588 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  30.38 
 
 
591 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.45 
 
 
592 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  31.81 
 
 
592 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33 
 
 
592 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.99 
 
 
588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.83 
 
 
593 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 
599 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.1 
 
 
591 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.42 
 
 
608 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.28 
 
 
587 aa  264  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  32.41 
 
 
609 aa  264  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.77 
 
 
602 aa  263  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 
588 aa  260  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.62 
 
 
606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  32.37 
 
 
606 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.89 
 
 
594 aa  257  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  32.29 
 
 
592 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  33 
 
 
592 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  33 
 
 
592 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  29.36 
 
 
620 aa  253  7e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  32.57 
 
 
588 aa  252  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  31.4 
 
 
614 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  33.11 
 
 
591 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  31.72 
 
 
613 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.06 
 
 
611 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.27 
 
 
605 aa  244  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  31.67 
 
 
596 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.1 
 
 
609 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.51 
 
 
609 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  29.77 
 
 
593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  28.76 
 
 
621 aa  240  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.55 
 
 
634 aa  240  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  28.32 
 
 
632 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.69 
 
 
616 aa  237  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  30.13 
 
 
609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.9 
 
 
581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  30.28 
 
 
611 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 
620 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  32.2 
 
 
599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  31.05 
 
 
620 aa  234  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  30.58 
 
 
622 aa  233  6e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.15 
 
 
610 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.15 
 
 
630 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.65 
 
 
610 aa  233  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  31.85 
 
 
619 aa  233  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.55 
 
 
610 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.98 
 
 
610 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  27.98 
 
 
610 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  28.9 
 
 
619 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  30.29 
 
 
612 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.71 
 
 
583 aa  231  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30 
 
 
609 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  30.41 
 
 
600 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30 
 
 
609 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  29.82 
 
 
590 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.04 
 
 
618 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 
587 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  30.29 
 
 
641 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  29.87 
 
 
615 aa  226  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.79 
 
 
604 aa  226  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.37 
 
 
610 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  28.41 
 
 
610 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  29.55 
 
 
608 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>