88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0554 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  100 
 
 		 330 aa  667    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  85.4 
 
 		 323 aa  533  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  85.22 
 
 		 322 aa  520  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  78.95 
 
 		 323 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  84.78 
 
 		 329 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  84.08 
 
 		 323 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  82.03 
 
 		 324 aa  483  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  81.38 
 
 		 326 aa  480  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  80.34 
 
 		 327 aa  463  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  79.66 
 
 		 349 aa  460  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  75.48 
 
 		 326 aa  459  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  78.23 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  73.7 
 
 		 324 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  83.04 
 
 		 333 aa  437  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  64.78 
 
 		 334 aa  418  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.23 
 
 		 320 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  61.92 
 
 		 320 aa  385  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.82 
 
 		 321 aa  381  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  61.64 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  59.69 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  59.06 
 
 		 319 aa  364  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.5 
 
 		 321 aa  358  5e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  62.32 
 
 		 333 aa  355  5e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  55.41 
 
 		 334 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  55.99 
 
 		 337 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  54.37 
 
 		 334 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  56.95 
 
 		 340 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  55.16 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.85 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  55.71 
 
 		 312 aa  324  2e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  54.37 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.64 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  54.37 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  56.12 
 
 		 337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  52.53 
 
 		 339 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  52.53 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  52.53 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  52.53 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  52.53 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  52.53 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  52.19 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  50 
 
 		 334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  49.66 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  47.1 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.86 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  46.53 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.55 
 
 		 315 aa  245  6e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  45.3 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.1 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  44.03 
 
 		 333 aa  241  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  43.34 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  43.34 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  46.25 
 
 		 327 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.2 
 
 		 308 aa  233  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  39.72 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  42.01 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.16 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.26 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  44.9 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.26 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  42.76 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  38.44 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  40.14 
 
 		 290 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  37.15 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  40.48 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.03 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  35.94 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  34.46 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.45 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  33.67 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  31.53 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  29.77 
 
 		 390 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  28.57 
 
 		 350 aa  125  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  27.42 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.75 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  25.08 
 
 		 447 aa  93.2  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  25.75 
 
 		 570 aa  93.2  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  26.1 
 
 		 601 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.93 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.9 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.34 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  32.16 
 
 		 713 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.89 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  25 
 
 		 691 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  22.12 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0502  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40 
 
 		 102 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0402  Transcription factor TFIIB cyclin-related  34.18 
 
 		 102 aa  45.8  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2469  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.36 
 
 		 102 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>