36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0537 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
485 aa  937    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  36.47 
 
 
484 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  36.14 
 
 
476 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  34.7 
 
 
479 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 
470 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 
475 aa  123  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
504 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  25.13 
 
 
490 aa  103  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  25.05 
 
 
478 aa  87.4  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
489 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
481 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  18.99 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 
483 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
490 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 
427 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.88 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.8 
 
 
517 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 
512 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
505 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.95 
 
 
522 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  22.91 
 
 
525 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 
447 aa  47  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 
489 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.11 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 
490 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  25.36 
 
 
511 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  21.11 
 
 
518 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2834  polysaccharide biosynthesis protein  30.11 
 
 
405 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.675495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
499 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  19.3 
 
 
471 aa  43.9  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  22.22 
 
 
524 aa  43.5  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.79 
 
 
483 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>