More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0458 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 
872 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 
871 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  54.64 
 
 
956 aa  892    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 
867 aa  678    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  44.41 
 
 
865 aa  636    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 
897 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 
863 aa  663    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 
873 aa  669    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  45.19 
 
 
853 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 
870 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  42.58 
 
 
872 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
865 aa  1707    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  64.29 
 
 
918 aa  1089    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
868 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  61.5 
 
 
917 aa  1037    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  61.66 
 
 
893 aa  1040    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 
870 aa  693    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 
887 aa  650    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.77 
 
 
869 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44 
 
 
932 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
896 aa  701    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 
869 aa  664    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
857 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  45.72 
 
 
848 aa  635  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 
891 aa  630  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  41.37 
 
 
910 aa  628  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 
910 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.39 
 
 
889 aa  627  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.66 
 
 
881 aa  625  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 
860 aa  625  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 
872 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.65 
 
 
853 aa  622  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.05 
 
 
882 aa  621  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.72 
 
 
857 aa  622  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 
900 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  42.61 
 
 
863 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 
882 aa  616  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 
903 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.88 
 
 
856 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 
856 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.88 
 
 
856 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 
856 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 
856 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 
870 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.91 
 
 
878 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
861 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  37.05 
 
 
872 aa  605  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  37.27 
 
 
873 aa  604  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  37.05 
 
 
872 aa  605  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  39.89 
 
 
859 aa  605  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 
861 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.89 
 
 
872 aa  599  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.28 
 
 
861 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 
861 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 
823 aa  598  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.23 
 
 
887 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 
862 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  38.97 
 
 
858 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 
793 aa  593  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 
862 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 
874 aa  595  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  37.87 
 
 
895 aa  592  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  44.44 
 
 
880 aa  590  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  38.6 
 
 
852 aa  592  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.3 
 
 
853 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  39.17 
 
 
858 aa  587  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 
850 aa  588  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 
856 aa  588  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 
853 aa  588  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.27 
 
 
862 aa  588  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
854 aa  585  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  36.45 
 
 
868 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 
837 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 
875 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 
854 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 
880 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 
855 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 
871 aa  579  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  39.62 
 
 
819 aa  580  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  37.88 
 
 
855 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  35.33 
 
 
848 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 
859 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 
854 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  38.13 
 
 
840 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  38.64 
 
 
858 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 
855 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 
793 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 
892 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 
881 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
868 aa  573  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.58 
 
 
859 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 
888 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 
855 aa  572  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 
854 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  38.39 
 
 
858 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  36.71 
 
 
892 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 
888 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  36.9 
 
 
890 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 
896 aa  568  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 
855 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>