41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0360 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 181 aa  358  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  67.78 
 
 		 173 aa  192  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  62.78 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  58.24 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  63.39 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  38.25 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 159 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  32.4 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 158 aa  91.3  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  29.61 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  30.37 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  25.7 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  29.14 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14374  predicted protein  32.58 
 
 		 104 aa  48.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123267  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69049  predicted protein  33.33 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  26.67 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  40.74 
 
 		 367 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 367 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  42.25 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8975  predicted protein  35.09 
 
 		 88 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 367 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  25.9 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 103 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>