More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0353 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 542 aa  1078    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  50.64 
 
 		 544 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  48.14 
 
 		 544 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  47.68 
 
 		 548 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  44.34 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  34.94 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  34.81 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  28.83 
 
 		 567 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 		 564 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  27.26 
 
 		 568 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  28.87 
 
 		 569 aa  210  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  32.05 
 
 		 457 aa  207  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  28.06 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 614 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 		 549 aa  193  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  27.87 
 
 		 576 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  30.98 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  36.29 
 
 		 293 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  24.82 
 
 		 568 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  34.56 
 
 		 225 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 		 346 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  28.97 
 
 		 346 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  33.01 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.14 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  32.59 
 
 		 395 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  30.04 
 
 		 332 aa  97.8  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  30.42 
 
 		 332 aa  97.4  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.89 
 
 		 347 aa  97.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 335 aa  96.7  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.66 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  32.85 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  29.31 
 
 		 350 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  29.31 
 
 		 350 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.47 
 
 		 330 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  28.46 
 
 		 337 aa  94.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27 
 
 		 332 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 346 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 351 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.36 
 
 		 351 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.24 
 
 		 350 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.89 
 
 		 350 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  28.63 
 
 		 384 aa  90.5  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.9 
 
 		 334 aa  90.1  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.9 
 
 		 334 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28.96 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.81 
 
 		 371 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  23.57 
 
 		 313 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  24.8 
 
 		 335 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.44 
 
 		 330 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  28.44 
 
 		 330 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.28 
 
 		 366 aa  88.6  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 		 350 aa  88.2  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  27.98 
 
 		 330 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  24.39 
 
 		 335 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  24.39 
 
 		 335 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.11 
 
 		 337 aa  87  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 330 aa  86.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  26.44 
 
 		 336 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  30.16 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  28.05 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 		 775 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.23 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 		 251 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  27.25 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.22 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.58 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.58 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.58 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  22.61 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  26.8 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  30.33 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  25.98 
 
 		 605 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.44 
 
 		 352 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  30.81 
 
 		 341 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  26.24 
 
 		 413 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 355 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.64 
 
 		 333 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  26.7 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  27.46 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  25.23 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  26.7 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  30.08 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  26.7 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  24.51 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  27.04 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  31.44 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  24.44 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  26.24 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  31.44 
 
 		 366 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  24.32 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.32 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  26.75 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  26.75 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  26.42 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>