More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0326 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
88 aa  179  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  75 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  76.4 
 
 
89 aa  139  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  73.03 
 
 
100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  66.29 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  46.51 
 
 
88 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  49.33 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.17 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  45.12 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  40 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  40.79 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  43.53 
 
 
90 aa  76.6  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  42.68 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  39.02 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  43.21 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  42.11 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  39.53 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  34.94 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  37.35 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  36.14 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  34.94 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  36.59 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  40.7 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  36.14 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  40.7 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  40 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  44.12 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  38.37 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  39.02 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  37.04 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  46.48 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.83 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  39.39 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  34.52 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  36.47 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  41.18 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  36.71 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  33.72 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.43 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  42.47 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  40 
 
 
282 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  38.57 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  36.9 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  40 
 
 
282 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  33.33 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  40 
 
 
282 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  41.46 
 
 
282 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  39.76 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  44.74 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  34.88 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  39.02 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  41.46 
 
 
282 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  33.72 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  38.37 
 
 
282 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  32.94 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  40.24 
 
 
282 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.2 
 
 
282 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  39.44 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  38.89 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  40.85 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  38.57 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  34.52 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  44.29 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  38.2 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  39.13 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  37.65 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  34.12 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  38.1 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  38.1 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  35.71 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  34.52 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  35.71 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  38.1 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  37.5 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  39.02 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  35.71 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  35.71 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  32.93 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  34.52 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  32.94 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  35.37 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  36.47 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  34.57 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  35.71 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  32.53 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  35.8 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  34.94 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  36.62 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  31.4 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  31.4 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  35.8 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  36.47 
 
 
285 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  31.4 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  40 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  31.71 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  40 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  37.35 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  35.71 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  31.33 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  32.56 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.12861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>