More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0317 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  100 
 
 		 680 aa  1340    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  38.19 
 
 		 644 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 		 537 aa  220  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  28.47 
 
 		 1071 aa  204  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  31.51 
 
 		 750 aa  197  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.64 
 
 		 700 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  34.23 
 
 		 553 aa  187  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  31.46 
 
 		 677 aa  177  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.12 
 
 		 728 aa  171  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 896 aa  171  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  27.84 
 
 		 843 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  30.79 
 
 		 952 aa  166  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  31.81 
 
 		 1059 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 532 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  29.83 
 
 		 1969 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  30.21 
 
 		 1081 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 654 aa  162  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  28.24 
 
 		 807 aa  157  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 		 587 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  28.54 
 
 		 781 aa  153  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  27.52 
 
 		 666 aa  151  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 		 737 aa  151  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  34.06 
 
 		 770 aa  150  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  29.3 
 
 		 919 aa  147  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 991 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  26.93 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.77 
 
 		 1820 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  28.33 
 
 		 982 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 1877 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  27.68 
 
 		 712 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  29.36 
 
 		 1216 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 1741 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 		 1589 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  27.75 
 
 		 834 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.14 
 
 		 1021 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  28.27 
 
 		 994 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.47 
 
 		 637 aa  130  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0188  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.21 
 
 		 578 aa  130  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  45.86 
 
 		 581 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 578 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0361  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.68 
 
 		 1254 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  42.14 
 
 		 760 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1178 aa  126  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.99 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  45.69 
 
 		 365 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.66 
 
 		 743 aa  124  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.37 
 
 		 905 aa  124  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.88 
 
 		 481 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 559 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  37.34 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  40.13 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 		 913 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.36 
 
 		 929 aa  122  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.15 
 
 		 1183 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.15 
 
 		 1183 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543508  normal  0.654737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  36.94 
 
 		 544 aa  120  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0347  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 		 723 aa  120  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  48.78 
 
 		 1317 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  43.44 
 
 		 853 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 1073 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0617  putative PAS/PAC sensor protein  41.22 
 
 		 580 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  39.42 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  39.42 
 
 		 541 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  37.67 
 
 		 544 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  40.15 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 369 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  38.32 
 
 		 531 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  36.14 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 524 aa  115  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.74 
 
 		 905 aa  115  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1292  putative PAS/PAC sensor protein  42.19 
 
 		 147 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  40.15 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35077  predicted protein  50 
 
 		 110 aa  114  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  35.86 
 
 		 541 aa  114  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 959 aa  114  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 354 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  40.97 
 
 		 411 aa  114  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1716  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.11 
 
 		 1238 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  34.23 
 
 		 364 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  30.94 
 
 		 1260 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 890 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  36.55 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 1138 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40751  predicted protein  47.22 
 
 		 734 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00189379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2986  PAS domain-containing protein  39.55 
 
 		 150 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1707  sensory box-containing diguanylate cyclase, putative  35.29 
 
 		 1057 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  38.27 
 
 		 533 aa  111  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  38.27 
 
 		 533 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  34.38 
 
 		 345 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 503 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.94 
 
 		 1017 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 334 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 488 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  40.43 
 
 		 570 aa  108  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 655 aa  108  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1787  putative PAS/PAC sensor protein  42.98 
 
 		 152 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>