More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0205 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  71.41 
 
 
908 aa  1352    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
905 aa  1856    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 
896 aa  1248    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  67.67 
 
 
892 aa  1213    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  64.09 
 
 
928 aa  1214    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
865 aa  611  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
886 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
886 aa  593  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
886 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
865 aa  588  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
886 aa  587  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
864 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 
802 aa  572  1e-161  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
906 aa  570  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 
863 aa  568  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
865 aa  566  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 
808 aa  568  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 
869 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
855 aa  559  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
863 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
809 aa  546  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
864 aa  541  9.999999999999999e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
858 aa  529  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
881 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
876 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
816 aa  501  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.69 
 
 
858 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  35.02 
 
 
861 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.77 
 
 
846 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  36.49 
 
 
886 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  37.2 
 
 
836 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
845 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 
903 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 
877 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
855 aa  474  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
808 aa  475  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
906 aa  475  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 
894 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 
860 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
885 aa  467  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
902 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
895 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
901 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
862 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.17 
 
 
916 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  33.45 
 
 
925 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
873 aa  449  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
871 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
911 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
885 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
872 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
882 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
880 aa  426  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 
881 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
881 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 
881 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
874 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
880 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
865 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
865 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 
883 aa  412  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
891 aa  412  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
884 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
771 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 
880 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
883 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 
879 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 
879 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
806 aa  405  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
799 aa  403  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
882 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
881 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
880 aa  402  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 
880 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 
897 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 
883 aa  396  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 
880 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
909 aa  396  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
799 aa  395  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
881 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
880 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
880 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
886 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  32.83 
 
 
895 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
867 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 
886 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
881 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
881 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
881 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 
885 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
881 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 
909 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2685  valyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
888 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000391784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
881 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 
888 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 
929 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
892 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 
881 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
881 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
881 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>