34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0194 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0194  DNA primase  100 
 
 		 537 aa  1025    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.112469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3256  TOPRIM domain protein  49.35 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1544  DNA primase  72.86 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.513524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1229  TOPRIM domain protein  67.02 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0699  DNA primase  56.4 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000129929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0361  DNA primase  59.16 
 
 		 434 aa  312  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0846  DNA primase  55.2 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1769  DNA primase  53.6 
 
 		 475 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0959  DNA primase  54.78 
 
 		 517 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0722  DNA primase  55.64 
 
 		 438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.000789623  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1017  DNA primase  56.88 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1395  TOPRIM domain protein  56.06 
 
 		 407 aa  295  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.145165  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1103  DNA primase  53.31 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0596  DNA primase  49.28 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.792701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0531  DNA primase  52.65 
 
 		 439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.956269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0307  DNA primase  52.45 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1388  DNA primase  52.45 
 
 		 438 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0741  DNA primase  44.73 
 
 		 464 aa  279  9e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.119048  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0501  DNA primase  47.73 
 
 		 426 aa  249  9e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1050  DNA primase  45.59 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00972841 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0960  DNA primase  44.06 
 
 		 405 aa  243  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.916463 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1886  DNA primase  44.83 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1321  DNA primase  43.3 
 
 		 403 aa  242  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0169  DNA primase  42.21 
 
 		 452 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0207779  normal  0.165101 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1059  TOPRIM domain protein  44.7 
 
 		 402 aa  230  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0877165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2153  DNA primase  41.89 
 
 		 413 aa  216  9e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000561406  hitchhiker  0.000473756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1302  DNA primase  40.32 
 
 		 380 aa  170  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000182826 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2135  DNA primase  43.48 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.218194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  30 
 
 		 579 aa  47.8  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  39.13 
 
 		 572 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  33 
 
 		 641 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  46.67 
 
 		 580 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  38.03 
 
 		 573 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  36.14 
 
 		 657 aa  43.9  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>