More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0155 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  44.33 
 
 
790 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  60.08 
 
 
760 aa  857    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
755 aa  1527    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  44.67 
 
 
778 aa  650    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.93 
 
 
762 aa  698    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.12 
 
 
771 aa  636    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  43.88 
 
 
777 aa  663    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  69.79 
 
 
783 aa  1043    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  44.54 
 
 
778 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  43.72 
 
 
772 aa  626  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.15 
 
 
795 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.52 
 
 
782 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  39.23 
 
 
788 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.11 
 
 
756 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 
805 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.11 
 
 
773 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.06 
 
 
785 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.97 
 
 
760 aa  495  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.21 
 
 
807 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.28 
 
 
806 aa  488  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.61 
 
 
769 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01600  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.62 
 
 
798 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  40.45 
 
 
791 aa  475  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3480  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.84 
 
 
778 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0869009  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1826  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.46 
 
 
771 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  38.53 
 
 
802 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  37.37 
 
 
811 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.66 
 
 
803 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.03 
 
 
807 aa  465  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2050  glycoside hydrolase family 3 protein  38.82 
 
 
817 aa  465  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3818  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.26 
 
 
790 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.9 
 
 
792 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.25 
 
 
809 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.94 
 
 
784 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  37.82 
 
 
789 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.63 
 
 
760 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  35.29 
 
 
808 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.58 
 
 
811 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.47 
 
 
754 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.25 
 
 
757 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.12 
 
 
733 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 
902 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.7 
 
 
760 aa  429  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  34.53 
 
 
743 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3326  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.67 
 
 
813 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172203  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2716  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.87 
 
 
768 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.378475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.17 
 
 
762 aa  413  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  32.81 
 
 
740 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  37.8 
 
 
737 aa  405  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  36.04 
 
 
739 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  35.62 
 
 
721 aa  402  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  35.31 
 
 
1037 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  36.53 
 
 
774 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  35.19 
 
 
772 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  37.04 
 
 
738 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  34.55 
 
 
859 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  34.92 
 
 
750 aa  389  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.17 
 
 
765 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.94 
 
 
799 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  34.17 
 
 
765 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  33.95 
 
 
755 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.03 
 
 
751 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  33.9 
 
 
755 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  34.03 
 
 
755 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  34.08 
 
 
765 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.59 
 
 
751 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  32.14 
 
 
743 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  34.03 
 
 
765 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  34.03 
 
 
765 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  34.03 
 
 
765 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  34.03 
 
 
765 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  34.03 
 
 
765 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 
753 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  33.77 
 
 
755 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  34.03 
 
 
765 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.76 
 
 
804 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  33.33 
 
 
772 aa  382  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  34.92 
 
 
768 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
766 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  34.03 
 
 
765 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1547  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.69 
 
 
768 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 
769 aa  379  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.38 
 
 
769 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.84 
 
 
801 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.63 
 
 
765 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.21 
 
 
702 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  36.15 
 
 
764 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  35.32 
 
 
764 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.75 
 
 
736 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  33.03 
 
 
766 aa  376  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.06 
 
 
768 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 
752 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  33.82 
 
 
765 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  34.48 
 
 
763 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  34.48 
 
 
763 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  35.18 
 
 
727 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  35.18 
 
 
727 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  34.9 
 
 
764 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  33.91 
 
 
763 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  34.34 
 
 
763 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>