23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0092 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
338 aa  687    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  62.99 
 
 
341 aa  418  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  53.13 
 
 
338 aa  340  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3898  hypothetical protein  47.79 
 
 
341 aa  290  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00564411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  46.27 
 
 
342 aa  275  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  26.26 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  31.13 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  29.95 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  32.64 
 
 
358 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  28.87 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  27.27 
 
 
392 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  29.19 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  26.2 
 
 
358 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  28.46 
 
 
382 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.23 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  26.77 
 
 
413 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  27.78 
 
 
393 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  26.29 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  28.24 
 
 
394 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  26.14 
 
 
593 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  23.81 
 
 
593 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  24.14 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>