178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0060 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  887    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  70.98 
 
 		 437 aa  624  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  39.16 
 
 		 437 aa  306  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  34.87 
 
 		 484 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  36.01 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  36.16 
 
 		 412 aa  236  7e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  33.86 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  30.36 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  32.09 
 
 		 412 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  31.85 
 
 		 436 aa  206  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  33.49 
 
 		 409 aa  192  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  27.87 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  29.62 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  30.08 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  28.31 
 
 		 448 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  28.44 
 
 		 435 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  27.29 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  28.72 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  28.24 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  27.59 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  27.07 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  24.04 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  27.74 
 
 		 436 aa  123  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  26.21 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  26.03 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  27.35 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  27.35 
 
 		 445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  27.35 
 
 		 445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  27.35 
 
 		 445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  25.84 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.32 
 
 		 722 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  26.14 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  23.74 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  22.38 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  21.17 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  23.27 
 
 		 647 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  28.51 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  27.92 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  23.96 
 
 		 482 aa  53.1  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.49 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  25.26 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  21.14 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  25.54 
 
 		 523 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  25.69 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  37.14 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  37.14 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  20.85 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  36 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  21.93 
 
 		 647 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  24.74 
 
 		 484 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  22.15 
 
 		 537 aa  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.84 
 
 		 578 aa  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.33 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  27.54 
 
 		 624 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  27.87 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  50 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  39.24 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  26.69 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  33.33 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  34.78 
 
 		 439 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  21.56 
 
 		 647 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  26.49 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  35.06 
 
 		 599 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  21.87 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  24.23 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  40 
 
 		 589 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  21.59 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.33 
 
 		 578 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  32.14 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.49 
 
 		 579 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  35.14 
 
 		 578 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  37.35 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  22.51 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  23.65 
 
 		 427 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  24.23 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  54.29 
 
 		 502 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  54.29 
 
 		 502 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  24.17 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  27.91 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.49 
 
 		 578 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  21.29 
 
 		 538 aa  46.6  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  22.78 
 
 		 493 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  23.12 
 
 		 483 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  23.91 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  23.45 
 
 		 466 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  23.45 
 
 		 466 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  26.71 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  61.11 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  48.84 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  44.23 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 577 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  34.15 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  29.76 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>