19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0055 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0055  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 
413 aa  763    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0613814  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.32 
 
 
409 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.979545  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1520  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.35 
 
 
415 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2339  protein of unknown function DUF112 transmembrane  57.66 
 
 
411 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145216 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3522  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.17 
 
 
413 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1004  hypothetical protein  33.56 
 
 
438 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2996  hypothetical protein  31.67 
 
 
466 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1492  hypothetical protein  35.32 
 
 
423 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0540  hypothetical protein  37.09 
 
 
403 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2746  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.67 
 
 
403 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.901506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0560  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.13 
 
 
418 aa  173  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0074  hypothetical protein  34.59 
 
 
408 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0191721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2266  hypothetical protein  33.16 
 
 
389 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.522249  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0515  hypothetical protein  36.11 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0783  hypothetical protein  23.99 
 
 
398 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0040  hypothetical protein  23.54 
 
 
398 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0824  hypothetical protein  25.44 
 
 
400 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0848  hypothetical protein  24.63 
 
 
398 aa  106  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.40812  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0576  protein of unknown function DUF112 transmembrane  24.42 
 
 
440 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.680015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>