More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0054 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
325 aa  650    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  62.08 
 
 
327 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  37.85 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.22 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.96 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.02 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.58 
 
 
341 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  37.65 
 
 
365 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.15 
 
 
354 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.24 
 
 
387 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.06 
 
 
351 aa  227  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.81 
 
 
354 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.54 
 
 
355 aa  225  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.71 
 
 
354 aa  225  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  36.96 
 
 
354 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.48 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.05 
 
 
353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  36.83 
 
 
380 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.27 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.91 
 
 
385 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.91 
 
 
385 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.14 
 
 
353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.29 
 
 
353 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.58 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.33 
 
 
354 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.5 
 
 
357 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.45 
 
 
356 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.99 
 
 
379 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
353 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.44 
 
 
357 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.7 
 
 
372 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.75 
 
 
363 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.57 
 
 
355 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.76 
 
 
354 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.76 
 
 
360 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.8 
 
 
387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.72 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.38 
 
 
372 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.92 
 
 
383 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.46 
 
 
390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  34.8 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.28 
 
 
327 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.11 
 
 
374 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.35 
 
 
382 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  32.7 
 
 
375 aa  192  7e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.44 
 
 
395 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.7 
 
 
355 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.48 
 
 
547 aa  189  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.48 
 
 
316 aa  189  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.18 
 
 
375 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  35.06 
 
 
367 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.23 
 
 
381 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.38 
 
 
374 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  29.81 
 
 
363 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.56 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.63 
 
 
362 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.85 
 
 
339 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  28.92 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 
355 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  28.92 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.4 
 
 
353 aa  179  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.79 
 
 
381 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.12 
 
 
291 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.79 
 
 
381 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.21 
 
 
352 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.8 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.21 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.6 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.22 
 
 
356 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.21 
 
 
333 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.62 
 
 
339 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.95 
 
 
322 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.78 
 
 
321 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.41 
 
 
322 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.25 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.43 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.27 
 
 
376 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.22 
 
 
360 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.28 
 
 
354 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.03 
 
 
324 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
324 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.87 
 
 
316 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.88 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  30.09 
 
 
325 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.52 
 
 
320 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.52 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  32.52 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  32.52 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.52 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  32.52 
 
 
320 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.52 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.17 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.52 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.01 
 
 
325 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.44 
 
 
325 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.34 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.48 
 
 
325 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.24 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.24 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>