More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0042 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
586 aa  1167    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  70.85 
 
 
614 aa  830    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  72.41 
 
 
598 aa  873    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1875  Cytochrome-c oxidase  52.3 
 
 
759 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  57.89 
 
 
511 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  45.87 
 
 
615 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  45.62 
 
 
526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  48.44 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  47.95 
 
 
641 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  45.9 
 
 
581 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  46.39 
 
 
594 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  47 
 
 
572 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  45.44 
 
 
561 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  46.71 
 
 
583 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  42.05 
 
 
546 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  45.21 
 
 
534 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  45.44 
 
 
574 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  44.6 
 
 
531 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  44.6 
 
 
531 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  44.4 
 
 
524 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  44.29 
 
 
593 aa  428  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  45.44 
 
 
558 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  44.82 
 
 
543 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  45.98 
 
 
529 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  40.56 
 
 
555 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  47.09 
 
 
605 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  40.56 
 
 
555 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  44.84 
 
 
543 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  46.37 
 
 
543 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  42.19 
 
 
535 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  46.32 
 
 
534 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.14 
 
 
566 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  46.53 
 
 
607 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  44.44 
 
 
596 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  45.15 
 
 
594 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  46.38 
 
 
537 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  44.4 
 
 
535 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  46.44 
 
 
538 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  46.23 
 
 
538 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  42.1 
 
 
543 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  44.15 
 
 
568 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
535 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  47.43 
 
 
539 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  45.33 
 
 
540 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  45.31 
 
 
536 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  43.03 
 
 
531 aa  422  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  44.91 
 
 
569 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  43 
 
 
531 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  46.2 
 
 
541 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  44.59 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  45.33 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  45 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  45.77 
 
 
564 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  44.42 
 
 
563 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  45.66 
 
 
526 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  45.2 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  46.09 
 
 
589 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  44.29 
 
 
544 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.49 
 
 
536 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  43 
 
 
550 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  44.98 
 
 
535 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  42.57 
 
 
530 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  42.89 
 
 
530 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  45 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  45.69 
 
 
560 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  42.89 
 
 
530 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  44.59 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  44.71 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  44.78 
 
 
535 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  44.22 
 
 
554 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  41.51 
 
 
530 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  42.28 
 
 
540 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  42.48 
 
 
530 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  42.71 
 
 
548 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  43.23 
 
 
534 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  42.63 
 
 
534 aa  415  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  44.62 
 
 
557 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.27 
 
 
560 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  44 
 
 
556 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  44.02 
 
 
560 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  42.48 
 
 
531 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  45.4 
 
 
592 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  42.48 
 
 
530 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  41.96 
 
 
555 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  43.06 
 
 
558 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  42.48 
 
 
530 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  44.4 
 
 
544 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  44.56 
 
 
590 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  44.85 
 
 
539 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  44.78 
 
 
535 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  43.6 
 
 
547 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  45.47 
 
 
573 aa  412  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  44.11 
 
 
594 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  44.03 
 
 
541 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  45.27 
 
 
602 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>