283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0035 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 		 362 aa  738    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  73.08 
 
 		 364 aa  551  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  55.08 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  51.27 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  48.33 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  46.33 
 
 		 510 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  44.48 
 
 		 466 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  45.67 
 
 		 499 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  45.67 
 
 		 499 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  44.41 
 
 		 451 aa  268  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  44.78 
 
 		 479 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  46.33 
 
 		 516 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  46.33 
 
 		 520 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  46.33 
 
 		 520 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  46.33 
 
 		 520 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  46.33 
 
 		 520 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  46.33 
 
 		 520 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  46.33 
 
 		 520 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  46.33 
 
 		 516 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  44.85 
 
 		 481 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  42.17 
 
 		 348 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  44.22 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  41.14 
 
 		 534 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  37.2 
 
 		 307 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.79 
 
 		 487 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 535 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  32.11 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.81 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  32.62 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  31.94 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.05 
 
 		 535 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  35.05 
 
 		 535 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.05 
 
 		 535 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.27 
 
 		 487 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  31.25 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  34.84 
 
 		 535 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  34.3 
 
 		 463 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  39.6 
 
 		 876 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  31.99 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  35.29 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  32.47 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  31.29 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  34.53 
 
 		 526 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  30.36 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  36 
 
 		 479 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  31.38 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  31.12 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  31.56 
 
 		 857 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  31.27 
 
 		 912 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  31.25 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  32.62 
 
 		 486 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  31.65 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  34.53 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  30 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  31.4 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  34.96 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  31.4 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  32.42 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  31.3 
 
 		 911 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  30.03 
 
 		 878 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  31.83 
 
 		 856 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  31.27 
 
 		 952 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  30.94 
 
 		 969 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  34.45 
 
 		 526 aa  99.4  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  30.94 
 
 		 470 aa  94.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  30.49 
 
 		 470 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  25.91 
 
 		 444 aa  89.4  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  27.78 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  32.76 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  31.6 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  28.46 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  28.62 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  24.31 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  24.31 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  28.64 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  29.02 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  28.04 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  26.93 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  30.13 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  29.68 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  36.75 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  30.11 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  27.84 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  27.84 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  27.84 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  28.3 
 
 		 468 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  27.23 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.26 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  28.27 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  26.36 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  29.15 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  27.49 
 
 		 431 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  27.49 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  28.64 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  22.65 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  27.8 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  27.15 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  24.26 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  26.09 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>