144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0021 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  70.05 
 
 
215 aa  297  9e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.61 
 
 
233 aa  256  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  42.66 
 
 
365 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  33.78 
 
 
369 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 
360 aa  98.6  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.27 
 
 
361 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39 
 
 
300 aa  96.3  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  46.15 
 
 
399 aa  96.3  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.19 
 
 
361 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.54 
 
 
338 aa  95.9  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  36.46 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.74 
 
 
349 aa  94.7  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.78 
 
 
370 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.88 
 
 
343 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  48.54 
 
 
345 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.75 
 
 
372 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.11 
 
 
349 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  46.08 
 
 
354 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.6 
 
 
356 aa  89  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.55 
 
 
364 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.16 
 
 
370 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.51 
 
 
374 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  38.67 
 
 
358 aa  86.3  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.87 
 
 
359 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.6 
 
 
355 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.63 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  35.8 
 
 
315 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  34.48 
 
 
346 aa  81.6  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.15 
 
 
441 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.77 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  42.73 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  43.22 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.34 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  28.99 
 
 
429 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
414 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
414 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
414 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.35 
 
 
382 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  40.82 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.51 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.37 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.8 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  34.08 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.1 
 
 
435 aa  69.3  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  51.79 
 
 
159 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.37 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  42.5 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.48 
 
 
199 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.27 
 
 
639 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.84 
 
 
139 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.95 
 
 
139 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.83 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.59 
 
 
148 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.21 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  37.37 
 
 
139 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.54 
 
 
141 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.86 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  50.91 
 
 
63 aa  54.7  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  41.38 
 
 
139 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  36.7 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
136 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.37 
 
 
253 aa  52.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.33 
 
 
159 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.83 
 
 
155 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.65 
 
 
130 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.88 
 
 
381 aa  52.4  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.19 
 
 
186 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.43 
 
 
141 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
175 aa  52  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  42.86 
 
 
181 aa  51.6  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  31.91 
 
 
168 aa  51.6  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  36.71 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.63 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.4 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.9 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.96 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.54 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.6 
 
 
122 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.81 
 
 
124 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.9 
 
 
640 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  28.68 
 
 
647 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.42 
 
 
642 aa  48.9  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  37.88 
 
 
151 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.1 
 
 
159 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
134 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  34.52 
 
 
160 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
95 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.23 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
135 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
644 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.16 
 
 
146 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
124 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.18 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  41.67 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>