More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0015 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0015  type II secretion system protein E  100 
 
 		 644 aa  1273    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529162  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5120  type II secretion system protein E  60.76 
 
 		 648 aa  700    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155589  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0195  type II secretion system protein E  45.95 
 
 		 650 aa  472  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3057  type II secretion system protein E  48.55 
 
 		 617 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.901701  normal  0.440204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3710  hypothetical protein  41.71 
 
 		 932 aa  279  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0047  type II secretion system protein E  38.5 
 
 		 514 aa  273  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  27.46 
 
 		 519 aa  126  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.87 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  27.17 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  31 
 
 		 492 aa  112  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  25.43 
 
 		 583 aa  110  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  29.55 
 
 		 556 aa  108  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  30.42 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  30.5 
 
 		 441 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 591 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 478 aa  104  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  31.62 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  29.22 
 
 		 671 aa  103  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  30.48 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  25.87 
 
 		 577 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  23.39 
 
 		 991 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  28.99 
 
 		 469 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  28.45 
 
 		 408 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  28.28 
 
 		 435 aa  101  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  28.46 
 
 		 485 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  26.08 
 
 		 510 aa  100  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  25.86 
 
 		 428 aa  100  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  28.19 
 
 		 457 aa  100  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  25.86 
 
 		 428 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  25.86 
 
 		 428 aa  100  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  30.18 
 
 		 449 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  29.69 
 
 		 407 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.62 
 
 		 408 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  28.52 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.8 
 
 		 453 aa  99.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  29.1 
 
 		 428 aa  99.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  28.83 
 
 		 482 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  30.3 
 
 		 477 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  28.7 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  30.68 
 
 		 478 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  28.47 
 
 		 407 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  27.88 
 
 		 549 aa  98.6  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  27.59 
 
 		 482 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  30.27 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  26.18 
 
 		 831 aa  98.2  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  26.84 
 
 		 479 aa  97.8  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  27.68 
 
 		 444 aa  97.8  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  24.88 
 
 		 463 aa  97.4  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  26.26 
 
 		 682 aa  97.4  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.68 
 
 		 463 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  32.3 
 
 		 422 aa  97.8  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 490 aa  97.8  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  28.31 
 
 		 449 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  27.68 
 
 		 444 aa  97.8  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  27.93 
 
 		 483 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  28.25 
 
 		 408 aa  97.4  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  29.91 
 
 		 452 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  25.26 
 
 		 473 aa  97.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  28.53 
 
 		 447 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  28.29 
 
 		 547 aa  97.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  29.18 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 485 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  29.07 
 
 		 480 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  27.12 
 
 		 572 aa  96.3  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1672  type II secretion system protein E  29.32 
 
 		 419 aa  96.3  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576695  normal  0.34743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  27.78 
 
 		 467 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  28.44 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  28.87 
 
 		 638 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  30.79 
 
 		 372 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  28.25 
 
 		 450 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  28.23 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  27.55 
 
 		 476 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  29.18 
 
 		 438 aa  96.3  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  29.19 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  28.25 
 
 		 450 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  28.25 
 
 		 450 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  29.89 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  28.23 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 624 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 438 aa  95.5  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  27.63 
 
 		 433 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  28.78 
 
 		 488 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  27.61 
 
 		 617 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  27.7 
 
 		 444 aa  94.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 442 aa  95.1  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  26.65 
 
 		 411 aa  95.1  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  26.02 
 
 		 847 aa  94.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  30.8 
 
 		 454 aa  94.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  27.89 
 
 		 620 aa  94.7  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  26.03 
 
 		 432 aa  94.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  27.97 
 
 		 455 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  28.99 
 
 		 484 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  27.19 
 
 		 460 aa  94  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  28.98 
 
 		 423 aa  94.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  29.26 
 
 		 542 aa  94  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  29.69 
 
 		 451 aa  94  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>