More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5263 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  100 
 
 
138 aa  273  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  59.42 
 
 
142 aa  150  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  51.09 
 
 
208 aa  132  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  44.53 
 
 
207 aa  117  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  43.97 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  39.16 
 
 
151 aa  110  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  39.72 
 
 
150 aa  105  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  46.21 
 
 
180 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 
143 aa  104  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  39.72 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  41.78 
 
 
159 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  44.2 
 
 
287 aa  101  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  44.29 
 
 
144 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  40.29 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  42.18 
 
 
156 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  41.67 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  36.17 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  41.5 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  40 
 
 
149 aa  96.7  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  41.91 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  40.58 
 
 
305 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  42.45 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  38.19 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.14 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  39.13 
 
 
153 aa  93.6  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  41.61 
 
 
280 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  43.36 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
144 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  39.04 
 
 
151 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  42.55 
 
 
307 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  44.12 
 
 
286 aa  91.3  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  43.7 
 
 
283 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  40.69 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.89 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.1 
 
 
153 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.29 
 
 
158 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  38.19 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  39.01 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  42.14 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  38.19 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.79 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.29 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.86 
 
 
288 aa  87.8  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.19 
 
 
304 aa  87.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  38.89 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.33 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  40.71 
 
 
415 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.03 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  40.29 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  39.26 
 
 
281 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  34.03 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.75 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.5 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.85 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.78 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  40.41 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  43.06 
 
 
162 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  37.68 
 
 
297 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  40 
 
 
171 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  43.07 
 
 
283 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 
153 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  34.06 
 
 
165 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.64 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.3 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.51 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.25 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.73 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  37.93 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  40.56 
 
 
320 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  39.31 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  41.67 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.96 
 
 
290 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  33.57 
 
 
301 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  41.26 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  41.55 
 
 
301 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  37.23 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  41.67 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  34.34 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.81 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  33.58 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>