113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5043 on replicon NC_013748
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  100 
 
 		 349 aa  712    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  34.75 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  34.75 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  34.75 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  34.75 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  34.51 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  32.31 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  36.59 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  36.61 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  36.61 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3652  hypothetical protein  42.27 
 
 		 171 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  33.58 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  35.71 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  33.05 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  34.85 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  33.1 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  33.05 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  33.08 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  34.43 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  34.81 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  34.45 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  33.6 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  32.65 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  31.9 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  32.56 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  33.59 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  34.82 
 
 		 247 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  36.29 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  33.85 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  32.26 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1559  restriction endonuclease  36.61 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000151262 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.81 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  29.03 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  30.15 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  29.23 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  31.82 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  33.33 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  29.93 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  32.52 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  32.03 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  33.9 
 
 		 260 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4245  restriction endonuclease  34.09 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114082  normal  0.143836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  30.47 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  31.3 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  29.93 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  30.51 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  30.89 
 
 		 171 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  26.09 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  32.08 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  31.39 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  31.16 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  31.97 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  28.48 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  31.16 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  24.85 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  33.91 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  32.64 
 
 		 304 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 454 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 374 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  32.33 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  30.3 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  30.19 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  31.58 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  28.45 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  30.3 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  30 
 
 		 169 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  28.46 
 
 		 454 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  28.36 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1255  restriction endonuclease  31.5 
 
 		 498 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.185862  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  28.68 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  31.16 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1622  hypothetical protein  30.89 
 
 		 207 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.792875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  30.4 
 
 		 453 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  27.59 
 
 		 287 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  30.71 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11011  hypothetical protein  31.06 
 
 		 145 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  35.29 
 
 		 128 aa  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  27.91 
 
 		 454 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11061  hypothetical protein  32.73 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  32 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  30.66 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4795  restriction endonuclease  32.73 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3913  restriction endonuclease  32.43 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  26.92 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  26.62 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  26.62 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  32.88 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1542  restriction endonuclease  26.57 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1742  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 189 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11051  hypothetical protein  31.82 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.117412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  26.87 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  29.63 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  23.81 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>