More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4750 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4752  BCCT transporter  58.27 
 
 
536 aa  636    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.337094  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 
542 aa  1073    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4708  choline/carnitine/betaine transporter  67.05 
 
 
552 aa  637    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4754  BCCT transporter  50.46 
 
 
552 aa  550  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2934  BCCT transporter  45.57 
 
 
545 aa  480  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3777  BCCT transporter  48.24 
 
 
563 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1055  BCCT transporter  45.94 
 
 
565 aa  451  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  40.41 
 
 
490 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  41.42 
 
 
503 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  41.83 
 
 
498 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  39.47 
 
 
504 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  38.52 
 
 
505 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  38.52 
 
 
505 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  38.52 
 
 
505 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  38.52 
 
 
505 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  38.52 
 
 
505 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  38.52 
 
 
505 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  39.43 
 
 
505 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  38.11 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  36.29 
 
 
506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  38.83 
 
 
541 aa  336  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  37.5 
 
 
504 aa  333  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  37.3 
 
 
504 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  37.06 
 
 
508 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  39.15 
 
 
531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  41.23 
 
 
497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  34.21 
 
 
551 aa  326  6e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  40.46 
 
 
525 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  37.01 
 
 
546 aa  324  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  38.75 
 
 
531 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  36.51 
 
 
600 aa  322  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  37.65 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  36.61 
 
 
548 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  38.85 
 
 
514 aa  321  3e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  36.61 
 
 
548 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  35.57 
 
 
523 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  41.91 
 
 
533 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  36.01 
 
 
526 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  38.04 
 
 
532 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  37.25 
 
 
685 aa  313  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  36.75 
 
 
520 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  36.75 
 
 
520 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  38.19 
 
 
577 aa  312  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  36.97 
 
 
542 aa  311  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  36.83 
 
 
516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  36.38 
 
 
637 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  36.85 
 
 
682 aa  310  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  37.4 
 
 
682 aa  310  5e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  37.5 
 
 
661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  36.67 
 
 
659 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  38.23 
 
 
573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  36.67 
 
 
659 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  35.19 
 
 
657 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  35.59 
 
 
538 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  36.44 
 
 
573 aa  306  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  34.92 
 
 
656 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  36.77 
 
 
660 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  38.1 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  36.82 
 
 
673 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  36.27 
 
 
668 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  37.65 
 
 
662 aa  301  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  35.43 
 
 
661 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  35.81 
 
 
667 aa  300  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  32.95 
 
 
530 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  36.66 
 
 
516 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  37.21 
 
 
582 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  34.64 
 
 
550 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  38.2 
 
 
573 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  34.91 
 
 
516 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  34.91 
 
 
516 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  34.91 
 
 
516 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  34.91 
 
 
516 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  34.91 
 
 
516 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  34.91 
 
 
516 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  35.04 
 
 
516 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  35.98 
 
 
580 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  35.63 
 
 
660 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  33.78 
 
 
544 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  34.44 
 
 
552 aa  297  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  35.83 
 
 
606 aa  297  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  34.5 
 
 
644 aa  297  4e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  37.01 
 
 
582 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  37.01 
 
 
582 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  36.52 
 
 
545 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  35.25 
 
 
661 aa  296  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  36.29 
 
 
687 aa  296  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  34.3 
 
 
637 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  35.67 
 
 
585 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  32.14 
 
 
606 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  34.48 
 
 
646 aa  295  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  35.87 
 
 
516 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  34.84 
 
 
676 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  39.57 
 
 
525 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  35.1 
 
 
661 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  35.4 
 
 
583 aa  294  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  38.12 
 
 
593 aa  294  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  36.12 
 
 
658 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  36.12 
 
 
658 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  36.12 
 
 
658 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  34.97 
 
 
558 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>