More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4679 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
335 aa  657    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.99 
 
 
340 aa  324  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.76 
 
 
367 aa  322  7e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.36 
 
 
312 aa  192  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.94 
 
 
302 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
310 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.97 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.75 
 
 
304 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 
317 aa  165  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 
331 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.45 
 
 
313 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.63 
 
 
313 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
306 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 
324 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  33.87 
 
 
297 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  26.26 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  28.77 
 
 
321 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
296 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  27.6 
 
 
303 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  31.02 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  32.89 
 
 
319 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.1 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.1 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.1 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.1 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.2 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.1 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  25.6 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  28.51 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.1 
 
 
301 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  29.32 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.76 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.1 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.76 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  30.58 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  26.67 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  29.82 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  29.82 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  27.36 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  29.82 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  29.82 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  27.93 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  29.82 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  29.82 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  29.24 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  30.47 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.15 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  30.71 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  29.31 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  29.37 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  29.82 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  31.13 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.98 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  23.08 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  29.3 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  29.1 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.43 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  28.52 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  31.32 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  26.42 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  30.26 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  30.39 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.67 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  29.9 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  31.05 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.19 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  30.36 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.24 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  27.92 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  29.21 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.96 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  25.4 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  28.67 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  28.67 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>