263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4504 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
510 aa  1035    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  49.81 
 
 
503 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  45.76 
 
 
537 aa  402  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  55.46 
 
 
699 aa  405  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  38.86 
 
 
341 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  38.41 
 
 
357 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  55.48 
 
 
582 aa  153  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  29.09 
 
 
829 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.39 
 
 
327 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  52.11 
 
 
566 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.33 
 
 
355 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.04 
 
 
352 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.33 
 
 
355 aa  123  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  32.53 
 
 
524 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.33 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  30.72 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  26.88 
 
 
571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.82 
 
 
341 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.12 
 
 
346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  34.16 
 
 
315 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.52 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.81 
 
 
337 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  26.44 
 
 
494 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  31.76 
 
 
491 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.91 
 
 
522 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  41.38 
 
 
1413 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  32.85 
 
 
331 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.13 
 
 
304 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.59 
 
 
319 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  24.58 
 
 
487 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  32.35 
 
 
598 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  25.38 
 
 
493 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.17 
 
 
472 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  39.86 
 
 
411 aa  100  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.02 
 
 
472 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.86 
 
 
466 aa  97.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  36.96 
 
 
789 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  28.88 
 
 
306 aa  94.7  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.8 
 
 
379 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  40.41 
 
 
737 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  43.26 
 
 
771 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  39.29 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  27.33 
 
 
472 aa  90.9  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.58 
 
 
507 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  26.78 
 
 
536 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 
495 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  38.64 
 
 
412 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.59 
 
 
520 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.36 
 
 
507 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.42 
 
 
474 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  37.86 
 
 
691 aa  87  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.49 
 
 
343 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.47 
 
 
562 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  38.24 
 
 
495 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  37.12 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  39.85 
 
 
897 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  27.13 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  39.26 
 
 
963 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  35.46 
 
 
2073 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  33.81 
 
 
1139 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  37.78 
 
 
576 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  37.5 
 
 
560 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.09 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
532 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.25 
 
 
560 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.33 
 
 
514 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  33.82 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  26.79 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  36.36 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.58 
 
 
1259 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.25 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.73 
 
 
366 aa  77  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32.88 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.27 
 
 
794 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 
572 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.75 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  33.53 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  23.68 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  24.1 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  30.66 
 
 
664 aa  73.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  32.26 
 
 
569 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  27.01 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  23.48 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  27.79 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.82 
 
 
618 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.04 
 
 
628 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.38 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  24.91 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.21 
 
 
695 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.79 
 
 
324 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.06 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  35.66 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.85 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  29.25 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  33.58 
 
 
563 aa  68.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  31.91 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  30.41 
 
 
884 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.09 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>