More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4496 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  69.19 
 
 
537 aa  734    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
503 aa  1028    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  48.84 
 
 
510 aa  422  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  44.29 
 
 
699 aa  302  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  40.74 
 
 
341 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  37.42 
 
 
357 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  67.13 
 
 
582 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  60.84 
 
 
566 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.33 
 
 
352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  30.95 
 
 
829 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.85 
 
 
357 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.64 
 
 
355 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.36 
 
 
355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.36 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  35.16 
 
 
598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.27 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  34.29 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  50 
 
 
411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.13 
 
 
327 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  34 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  31.17 
 
 
315 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  30.15 
 
 
472 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.01 
 
 
319 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.83 
 
 
346 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.83 
 
 
343 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.06 
 
 
487 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  30.39 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.21 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  43.57 
 
 
1413 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  32.42 
 
 
337 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  45.86 
 
 
897 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 
636 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.29 
 
 
522 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  43.61 
 
 
412 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  30.67 
 
 
304 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  26.22 
 
 
494 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.41 
 
 
507 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  26.52 
 
 
571 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  27.95 
 
 
524 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  41.38 
 
 
507 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  40.14 
 
 
771 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  28.3 
 
 
495 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  41.67 
 
 
789 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  24.95 
 
 
493 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  38.89 
 
 
1259 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  38.24 
 
 
691 aa  97.8  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.18 
 
 
366 aa  97.1  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 
345 aa  97.1  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 
543 aa  96.7  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  38 
 
 
963 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  41.35 
 
 
491 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  30.63 
 
 
306 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.27 
 
 
379 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
572 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.69 
 
 
466 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.85 
 
 
507 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.06 
 
 
514 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  27.98 
 
 
315 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.33 
 
 
334 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 
512 aa  90.5  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  23.32 
 
 
522 aa  90.1  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  42.86 
 
 
436 aa  90.1  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.78 
 
 
562 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.51 
 
 
520 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  36.48 
 
 
569 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  40.15 
 
 
495 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  25.17 
 
 
480 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.51 
 
 
474 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  23.95 
 
 
522 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.73 
 
 
560 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.39 
 
 
536 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.29 
 
 
503 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  23.61 
 
 
522 aa  86.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  34.31 
 
 
672 aa  87  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  26.27 
 
 
472 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  36.76 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 
804 aa  84.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 
532 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  33.81 
 
 
737 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  38.67 
 
 
392 aa  84  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.98 
 
 
707 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
340 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  28.23 
 
 
320 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  30.47 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 
476 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.68 
 
 
794 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  33.91 
 
 
1139 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.57 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  31.72 
 
 
563 aa  80.1  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  38.3 
 
 
982 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  26.35 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  25.52 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  34.53 
 
 
576 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  27.38 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.55 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  27.96 
 
 
703 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>