197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4456 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  100 
 
 		 395 aa  772    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  51.69 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  48.06 
 
 		 408 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  48.06 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  48.06 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  48.06 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  48.06 
 
 		 408 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  49.35 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  43.08 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  40.05 
 
 		 505 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  40.1 
 
 		 388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  41.09 
 
 		 509 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  41.44 
 
 		 538 aa  275  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  39.56 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  40.94 
 
 		 511 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  43.28 
 
 		 508 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  40.59 
 
 		 526 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  38.57 
 
 		 508 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  42.64 
 
 		 517 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  38.93 
 
 		 513 aa  269  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  43.33 
 
 		 507 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  43.33 
 
 		 507 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  43.33 
 
 		 507 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  43.54 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  39.26 
 
 		 523 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  39.45 
 
 		 507 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  38.18 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  40.59 
 
 		 507 aa  262  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  40.24 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  40.54 
 
 		 513 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  41.65 
 
 		 507 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  39.45 
 
 		 507 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  40.29 
 
 		 513 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  41.49 
 
 		 508 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  38.96 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  40.05 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  38.24 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  40.1 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  39.18 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  41.88 
 
 		 507 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  37.75 
 
 		 509 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  39.15 
 
 		 508 aa  255  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  41.23 
 
 		 525 aa  255  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  39.25 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  39.22 
 
 		 523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  39.11 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  40.05 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  41.73 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  40.05 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  38.25 
 
 		 510 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  39.55 
 
 		 500 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  40.1 
 
 		 385 aa  252  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  38.77 
 
 		 510 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  41.62 
 
 		 507 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  39.3 
 
 		 500 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  39.51 
 
 		 501 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  38.96 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  44.09 
 
 		 512 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  38.73 
 
 		 523 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  41.03 
 
 		 533 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  38.27 
 
 		 515 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  40 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  40.93 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  38.05 
 
 		 509 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  40.67 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  38.95 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  38.06 
 
 		 509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  38.39 
 
 		 508 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  37.63 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  36.88 
 
 		 514 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  36.88 
 
 		 514 aa  242  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  38.75 
 
 		 509 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  40.98 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  36.88 
 
 		 514 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  39.84 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  38.86 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  39.84 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  39.54 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  38.62 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  39.84 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  38.87 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  39.58 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  38.14 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  37.59 
 
 		 435 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  40 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  39.74 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  41.01 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  40 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  38.25 
 
 		 450 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  39.43 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  38.25 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  31.35 
 
 		 493 aa  226  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  38.5 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  38.9 
 
 		 500 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  38.21 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  37.4 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  38.52 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  35.81 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  37.53 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2373  UxaA family hydrolase  36.75 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>