185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4440 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  100 
 
 
566 aa  1145    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  62.56 
 
 
670 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  64.94 
 
 
1011 aa  486  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  45.67 
 
 
710 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  47.35 
 
 
701 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  38.92 
 
 
467 aa  239  9e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  33.5 
 
 
431 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  32.99 
 
 
425 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  33.42 
 
 
421 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  33.02 
 
 
421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  60.27 
 
 
582 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  61.38 
 
 
537 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  55.31 
 
 
503 aa  157  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  55.94 
 
 
411 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  31.66 
 
 
446 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  31.44 
 
 
1031 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  49.44 
 
 
510 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  30.97 
 
 
450 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  29.78 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  30.79 
 
 
425 aa  124  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  27.49 
 
 
459 aa  118  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  44.2 
 
 
412 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.43 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  40.54 
 
 
1413 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  31.65 
 
 
682 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  40 
 
 
571 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  43.66 
 
 
472 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.61 
 
 
474 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  41.73 
 
 
1139 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  41.3 
 
 
691 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  42.47 
 
 
789 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.15 
 
 
466 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  41.61 
 
 
401 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  40 
 
 
494 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  44.36 
 
 
897 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  40.41 
 
 
576 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  27.44 
 
 
454 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  41.67 
 
 
507 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.88 
 
 
507 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  42.34 
 
 
495 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  44.2 
 
 
436 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.84 
 
 
695 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.39 
 
 
507 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  30.09 
 
 
593 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  37.84 
 
 
963 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  39.86 
 
 
430 aa  94  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  33.16 
 
 
498 aa  92.8  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  34.68 
 
 
770 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  39.04 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  39.39 
 
 
491 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  35.51 
 
 
672 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  27.64 
 
 
537 aa  87.4  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.19 
 
 
737 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  32.35 
 
 
503 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  36.61 
 
 
943 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.5 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  37.96 
 
 
771 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  36.17 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  35.5 
 
 
772 aa  83.6  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.66 
 
 
474 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.14 
 
 
794 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.65 
 
 
507 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  37.12 
 
 
487 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  33.8 
 
 
569 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  37.76 
 
 
560 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.34 
 
 
999 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  29.26 
 
 
565 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  26.67 
 
 
541 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  33.91 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  33.81 
 
 
230 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.61 
 
 
514 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  35.66 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.33 
 
 
1259 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  30.51 
 
 
570 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.8 
 
 
982 aa  77  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  36.05 
 
 
744 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  35.81 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  34.31 
 
 
615 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  39.57 
 
 
1187 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  32 
 
 
2073 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  33.14 
 
 
1023 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  34.69 
 
 
863 aa  73.6  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  30.43 
 
 
568 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  28.89 
 
 
884 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  33.12 
 
 
924 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  35.66 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.4 
 
 
647 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  33.33 
 
 
644 aa  70.5  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.63 
 
 
957 aa  70.1  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  28.93 
 
 
551 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  36.03 
 
 
824 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  28.57 
 
 
701 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  33.77 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.56 
 
 
756 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  32.35 
 
 
445 aa  67  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  29.2 
 
 
664 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  35.04 
 
 
709 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  28.99 
 
 
483 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  33.59 
 
 
843 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  25.85 
 
 
473 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>