More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4436 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4436  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
311 aa  630  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0722382  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4210  dihydrodipicolinate synthetase  37.09 
 
 
319 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4457  dihydrodipicolinate synthetase  37.62 
 
 
312 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0032522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0033  dihydrodipicolinate synthetase  41.2 
 
 
305 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4216  dihydrodipicolinate synthetase  33.57 
 
 
320 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0462427  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3336  dihydrodipicolinate synthetase  29.9 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0196  dihydrodipicolinate synthetase  32.86 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4464  dihydrodipicolinate synthetase  28.76 
 
 
299 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  29.77 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1993  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.17 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5443  dihydrodipicolinate synthetase  31.45 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344282  hitchhiker  0.00661581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1793  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.17 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5174  dihydrodipicolinate synthetase  30.98 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0202491  normal  0.065211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2587  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.23 
 
 
303 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233222  hitchhiker  0.00609542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.92 
 
 
313 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.46 
 
 
307 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
314 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4201  dihydrodipicolinate synthetase  29.05 
 
 
308 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5157  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.75 
 
 
321 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414541  hitchhiker  0.0087046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5532  dihydrodipicolinate synthetase  29.37 
 
 
301 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  25.58 
 
 
313 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  27.55 
 
 
291 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 
295 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2499  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  32.32 
 
 
304 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.62 
 
 
311 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0185  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.18 
 
 
336 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1030  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.37 
 
 
313 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113729  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.35 
 
 
303 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612252  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3599  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.35 
 
 
303 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815897  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3098  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.35 
 
 
303 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 
307 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1084  dihydrodipicolinate synthetase  31.13 
 
 
301 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00262766  hitchhiker  0.00208818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2392  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  32.51 
 
 
304 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.088042  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4586  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.67 
 
 
312 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4452  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.67 
 
 
312 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4951  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.13 
 
 
304 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551688  normal  0.0100534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3049  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.13 
 
 
304 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.13 
 
 
304 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  30.48 
 
 
297 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3408  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.8 
 
 
304 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.996701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3688  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.86 
 
 
304 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4736  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.74 
 
 
304 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1729  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.57 
 
 
303 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00000952381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2814  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.88 
 
 
303 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  27.14 
 
 
291 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  30.49 
 
 
295 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2020  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 
301 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  31.46 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1215  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.76 
 
 
303 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0332  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.36 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0351  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.11 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4227  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.46 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1875  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.92 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207996  normal  0.131652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1947  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.32 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7513  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.94 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 
293 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0827  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.88 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0328842  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5204  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.36 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484805  normal  0.145003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4676  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.36 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4549  dihydrodipicolinate synthetase family protein  26.46 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5150  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.32 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0037  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.39 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  29.68 
 
 
295 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  25.91 
 
 
297 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 
292 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0251  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.13 
 
 
303 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4864  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25.86 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556224  normal  0.0460344 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  28.05 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05220  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.29 
 
 
303 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6531  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  27.41 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3419  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  24.04 
 
 
328 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269003  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  27.53 
 
 
291 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1802  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.21 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0287622  hitchhiker  0.00208874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2666  dihydrodipicolinate synthetase  26.95 
 
 
331 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 
291 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5081  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.42 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  26.13 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3371  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.43 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1718  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.57 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.19 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1596  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.22 
 
 
303 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>