102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4255 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  59.9 
 
 
190 aa  229  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  62.5 
 
 
188 aa  219  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.36 
 
 
193 aa  207  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  40.76 
 
 
178 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  42.53 
 
 
174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  33.72 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  35 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  35 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  35 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  34.27 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  35.26 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  32.4 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  34.09 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  33.52 
 
 
178 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  34.29 
 
 
180 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  32 
 
 
179 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  33.52 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  32.2 
 
 
176 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  33.14 
 
 
179 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  32.95 
 
 
173 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  31.64 
 
 
181 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  31.64 
 
 
181 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  31.64 
 
 
181 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  31.64 
 
 
181 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  31.64 
 
 
181 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  31.64 
 
 
181 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  32.95 
 
 
173 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  31.64 
 
 
181 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  32.77 
 
 
175 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  31.43 
 
 
181 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 
181 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  30.56 
 
 
177 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0813  protoporphyrinogen oxidase  31.82 
 
 
173 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  30.68 
 
 
173 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  30.11 
 
 
173 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  33.71 
 
 
181 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  33.71 
 
 
181 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  33.71 
 
 
181 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  33.71 
 
 
181 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  33.71 
 
 
181 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  31.79 
 
 
179 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  30.11 
 
 
173 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  30.34 
 
 
176 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  30.11 
 
 
173 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  30.64 
 
 
175 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000262535  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  32.57 
 
 
175 aa  98.2  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0028  protoporphyrinogen oxidase  31.76 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000780551  hitchhiker  0.000000145429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  31.84 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  29.51 
 
 
179 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0022  protoporphyrinogen oxidase  31.18 
 
 
174 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000530188  hitchhiker  0.000763246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0020  protoporphyrinogen oxidase  31.18 
 
 
174 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000664462  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0036  protoporphyrinogen oxidase  33.15 
 
 
177 aa  95.9  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0027  protoporphyrinogen oxidase  30.06 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00412155  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0022  protoporphyrinogen oxidase  30.06 
 
 
175 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0020  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000993803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2537  protoporphyrinogen oxidase  31.98 
 
 
174 aa  95.1  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0024  Protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 
174 aa  94.4  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.776203  hitchhiker  0.00000179508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  32 
 
 
175 aa  94.4  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0024  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 
174 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0780321  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0025  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 
174 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 
174 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  31.07 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0019  protoporphyrinogen oxidase  30.06 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  27.93 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0030  protoporphyrinogen oxidase  27.47 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000025966  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  31.4 
 
 
170 aa  92.4  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0025  protoporphyrinogen oxidase  27.91 
 
 
175 aa  91.3  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0022  protoporphyrinogen oxidase  26.92 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00158221  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  30.06 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0024  protoporphyrinogen oxidase  26.92 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.000782857 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0025  flavodoxin  29.17 
 
 
174 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0027  protoporphyrinogen oxidase, putative  26.92 
 
 
184 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0019  protoporphyrinogen oxidase  26.44 
 
 
184 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  27.01 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0029  protoporphyrinogen oxidase  26.37 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0027  protoporphyrinogen oxidase  26.37 
 
 
183 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0370554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0026  Protoporphyrinogen oxidase  26.37 
 
 
183 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000181014 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09631  putative protoporphyrinogen oxidase  25.71 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0022  protoporphyrinogen oxidase  25.82 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0671098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  27.01 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3720  hypothetical protein  30.71 
 
 
141 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0026  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00716362  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0038  protoporphyrinogen oxidase  26.7 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  29.58 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0852  protoporphyrinogen oxidase  27.53 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0227417  normal  0.141132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  29.45 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  29.55 
 
 
168 aa  61.2  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  24.26 
 
 
172 aa  61.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  28.57 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  21.99 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  28.17 
 
 
159 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  28.98 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.86 
 
 
174 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  26.14 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0855  hypothetical protein  30.89 
 
 
237 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.110269  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  20.57 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  27.53 
 
 
173 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>