More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4231 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
415 aa  787    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
391 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 
385 aa  155  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  32.93 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 
383 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.68 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  29.46 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
420 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  28.05 
 
 
384 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
411 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  26.72 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
414 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
399 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.94 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  29.1 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  24.75 
 
 
432 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  24.75 
 
 
432 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  24.69 
 
 
432 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  24.24 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  27.2 
 
 
409 aa  86.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  24.24 
 
 
432 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
400 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  33.78 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  26.39 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  33.33 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  29.75 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  29.55 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  25.94 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  27.3 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.32 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  29.94 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.19 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.19 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.75 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.19 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  33.87 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  34.59 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  34.59 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  35.2 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.47 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  29.71 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.47 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  29.71 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  28.28 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  24.6 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  28.78 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  24.56 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  30.82 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.28 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.89 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  29.51 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  25.94 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0064  chloramphenicol resistance protein  27.39 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.629663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.78 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  28.85 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.38 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  22.49 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  34.34 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.08 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.701434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.69 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.61 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.72 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  30.86 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  32.43 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.38 
 
 
525 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01910  arabinose efflux permease family protein  32 
 
 
435 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  28.14 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.7 
 
 
489 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  36.25 
 
 
465 aa  67  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  34.59 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 
525 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  26.67 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
499 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  26.71 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>