More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4220 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  100 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  71.43 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  68.91 
 
 		 120 aa  177  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  60.17 
 
 		 119 aa  147  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  61.76 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  52.14 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  50.49 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  43.88 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  51.19 
 
 		 272 aa  97.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  49.43 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  42 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  50 
 
 		 302 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  44.21 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  46.67 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  43.48 
 
 		 109 aa  94.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  42.42 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  43 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  46.67 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  40.59 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  40.62 
 
 		 98 aa  93.6  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  41.18 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  44.9 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  46.43 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  40.59 
 
 		 269 aa  92.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  40.4 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  44.33 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  44.33 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  45.56 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  41 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  41 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  39.6 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  39.6 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  39.6 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  50.59 
 
 		 280 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  40.57 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  39.6 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  36.13 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  40.78 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  40.78 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  47.67 
 
 		 299 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  40.78 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  48.78 
 
 		 280 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  43.01 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  40.59 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  41.49 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  50.62 
 
 		 285 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  40.86 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  47.17 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  40.59 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  42.22 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  39.39 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  44.21 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  38.61 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  40.2 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  39.81 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  39.6 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  40.4 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  38.46 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  38.61 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  40.38 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  42.42 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  39.8 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  44.55 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  39.42 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  39.42 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  37.38 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  41.51 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  47.62 
 
 		 318 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  41.51 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  42.11 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  44.68 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  41.51 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  47.62 
 
 		 286 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  41.51 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  40.38 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  50.62 
 
 		 285 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  48.78 
 
 		 301 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  48.78 
 
 		 282 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>