More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4214 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
414 aa  810    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
381 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.4 
 
 
421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  26.72 
 
 
397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
414 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  27.17 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  28.53 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  24.81 
 
 
404 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  27.46 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  26.87 
 
 
423 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  27.35 
 
 
402 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  29.34 
 
 
409 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  26.57 
 
 
423 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  27.32 
 
 
403 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  26.54 
 
 
409 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  26.9 
 
 
396 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
399 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  31.09 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  26.8 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
385 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
400 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  26.02 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  28.77 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  24.92 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  25.67 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.08 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  28.94 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  28.94 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  28.94 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  25.76 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
391 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.13 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  25.68 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.93 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 
620 aa  73.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  22.96 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.41 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.41 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.41 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
512 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.41 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.23 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  33.05 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.7 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  25.98 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  32.37 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  24.93 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  25.26 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  22.03 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3235  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.81 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154906  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  24.4 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1469  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  24.44 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.87 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  24.57 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.94 
 
 
539 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.81 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  25 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 
511 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
243 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4030  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
394 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 
593 aa  67  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3923  major facilitator superfamily transporter  26.24 
 
 
462 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.603899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.44 
 
 
405 aa  67  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  32.73 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  28.39 
 
 
683 aa  66.6  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.76 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  35.14 
 
 
449 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
489 aa  66.2  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  26.5 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.9 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.04 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>