More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4142 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 124 aa  246  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  67.46 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  65.87 
 
 		 127 aa  165  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  65.08 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  59.84 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  54.1 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  54.84 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  52.1 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  54.21 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  55.37 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  49.19 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  53.6 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  53.51 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 126 aa  126  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  45.83 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  51.56 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  52.99 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  42.74 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  47.9 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  46.03 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  47.5 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  48.85 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  43.8 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  47.9 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  50.94 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  50.96 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  53.27 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  48.31 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 127 aa  119  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>